Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zscan5bB2RTN3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zscan5bB2RTN3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zscan5bB2RTN3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Zscan5bB2RTN3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zscan5bB2RTN3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zscan5bB2RTN3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zscan5bB2RTN3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zscan5bB2RTN3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zscan5bB2RTN3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zscan5bB2RTN3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Zscan5bB2RTN3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zscan5bB2RTN3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zscan5bB2RTN3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zscan5bB2RTN3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zscan5bB2RTN3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zscan5bB2RTN3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zscan5bB2RTN3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zscan5bB2RTN3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zscan5bB2RTN3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zscan5bB2RTN3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zscan5bB2RTN3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zscan5bB2RTN3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zscan5bB2RTN3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zscan5bB2RTN3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zscan5bB2RTN3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zscan5bB2RTN3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zscan5bB2RTN3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zscan5bB2RTN3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zscan5bB2RTN3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zscan5bB2RTN3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Zscan5bB2RTN3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Zscan5bB2RTN3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zscan5bB2RTN3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zscan5bB2RTN3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zscan5bB2RTN3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zscan5bB2RTN3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zscan5bB2RTN3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zscan5bB2RTN3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zscan5bB2RTN3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zscan5bB2RTN3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zscan5bB2RTN3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zscan5bB2RTN3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zscan5bB2RTN3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zscan5bB2RTN3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zscan5bB2RTN3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Zscan5bB2RTN3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zscan5bB2RTN3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zscan5bB2RTN3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zscan5bB2RTN3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zscan5bB2RTN3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zscan5bB2RTN3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zscan5bB2RTN3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zscan5bB2RTN3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zscan5bB2RTN3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zscan5bB2RTN3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zscan5bB2RTN3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zscan5bB2RTN3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zscan5bB2RTN3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zscan5bB2RTN3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zscan5bB2RTN3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zscan5bB2RTN3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zscan5bB2RTN3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zscan5bB2RTN3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zscan5bB2RTN3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zscan5bB2RTN3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zscan5bB2RTN3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zscan5bB2RTN3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zscan5bB2RTN3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zscan5bB2RTN3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zscan5bB2RTN3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zscan5bB2RTN3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zscan5bB2RTN3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zscan5bB2RTN3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zscan5bB2RTN3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zscan5bB2RTN3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zscan5bB2RTN3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zscan5bB2RTN3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zscan5bB2RTN3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zscan5bB2RTN3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zscan5bB2RTN3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zscan5bB2RTN3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zscan5bB2RTN3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Zscan5bB2RTN3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zscan5bB2RTN3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zscan5bB2RTN3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zscan5bB2RTN3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Zscan5bB2RTN3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zscan5bB2RTN3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zscan5bB2RTN3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zscan5bB2RTN3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zscan5bB2RTN3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zscan5bB2RTN3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zscan5bB2RTN3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Zscan5bB2RTN3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zscan5bB2RTN3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zscan5bB2RTN3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zscan5bB2RTN3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zscan5bB2RTN3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zscan5bB2RTN3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms