Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Apol7aB2RT54 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Apol7aB2RT54 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Apol7aB2RT54 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Apol7aB2RT54 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Apol7aB2RT54 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Apol7aB2RT54 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Apol7aB2RT54 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Apol7aB2RT54 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Apol7aB2RT54 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Apol7aB2RT54 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Apol7aB2RT54 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Apol7aB2RT54 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Apol7aB2RT54 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Apol7aB2RT54 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Apol7aB2RT54 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Apol7aB2RT54 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Apol7aB2RT54 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Apol7aB2RT54 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Apol7aB2RT54 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Apol7aB2RT54 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Apol7aB2RT54 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Apol7aB2RT54 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Apol7aB2RT54 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Apol7aB2RT54 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Apol7aB2RT54 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Apol7aB2RT54 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Apol7aB2RT54 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Apol7aB2RT54 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Apol7aB2RT54 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Apol7aB2RT54 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Apol7aB2RT54 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Apol7aB2RT54 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Apol7aB2RT54 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Apol7aB2RT54 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Apol7aB2RT54 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Apol7aB2RT54 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Apol7aB2RT54 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Apol7aB2RT54 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Apol7aB2RT54 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Apol7aB2RT54 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Apol7aB2RT54 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Apol7aB2RT54 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Apol7aB2RT54 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Apol7aB2RT54 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Apol7aB2RT54 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Apol7aB2RT54 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Apol7aB2RT54 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Apol7aB2RT54 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Apol7aB2RT54 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Apol7aB2RT54 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Apol7aB2RT54 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Apol7aB2RT54 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Apol7aB2RT54 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Apol7aB2RT54 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Apol7aB2RT54 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Apol7aB2RT54 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Apol7aB2RT54 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Apol7aB2RT54 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Apol7aB2RT54 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Apol7aB2RT54 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Apol7aB2RT54 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Apol7aB2RT54 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Apol7aB2RT54 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Apol7aB2RT54 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Apol7aB2RT54 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Apol7aB2RT54 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Apol7aB2RT54 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Apol7aB2RT54 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Apol7aB2RT54 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Apol7aB2RT54 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Apol7aB2RT54 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Apol7aB2RT54 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Apol7aB2RT54 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Apol7aB2RT54 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Apol7aB2RT54 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Apol7aB2RT54 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Apol7aB2RT54 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Apol7aB2RT54 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Apol7aB2RT54 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Apol7aB2RT54 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Apol7aB2RT54 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Apol7aB2RT54 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Apol7aB2RT54 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Apol7aB2RT54 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Apol7aB2RT54 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Apol7aB2RT54 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Apol7aB2RT54 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Apol7aB2RT54 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Apol7aB2RT54 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Apol7aB2RT54 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Apol7aB2RT54 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Apol7aB2RT54 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Apol7aB2RT54 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Apol7aB2RT54 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Apol7aB2RT54 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Apol7aB2RT54 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Apol7aB2RT54 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Apol7aB2RT54 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Apol7aB2RT54 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms