Protein–RNA interactions for Protein: B2RRL2

Jrkl, Jerky protein homolog-like, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrklB2RRL2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
JrklB2RRL2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
JrklB2RRL2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
JrklB2RRL2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
JrklB2RRL2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
JrklB2RRL2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
JrklB2RRL2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
JrklB2RRL2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
JrklB2RRL2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
JrklB2RRL2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
JrklB2RRL2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
JrklB2RRL2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
JrklB2RRL2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
JrklB2RRL2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
JrklB2RRL2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
JrklB2RRL2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
JrklB2RRL2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
JrklB2RRL2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
JrklB2RRL2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
JrklB2RRL2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
JrklB2RRL2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
JrklB2RRL2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
JrklB2RRL2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
JrklB2RRL2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
JrklB2RRL2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
JrklB2RRL2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
JrklB2RRL2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
JrklB2RRL2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
JrklB2RRL2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
JrklB2RRL2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
JrklB2RRL2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
JrklB2RRL2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
JrklB2RRL2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
JrklB2RRL2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
JrklB2RRL2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
JrklB2RRL2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
JrklB2RRL2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
JrklB2RRL2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
JrklB2RRL2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
JrklB2RRL2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
JrklB2RRL2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
JrklB2RRL2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
JrklB2RRL2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
JrklB2RRL2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
JrklB2RRL2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
JrklB2RRL2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
JrklB2RRL2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
JrklB2RRL2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
JrklB2RRL2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
JrklB2RRL2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
JrklB2RRL2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
JrklB2RRL2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
JrklB2RRL2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
JrklB2RRL2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
JrklB2RRL2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
JrklB2RRL2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
JrklB2RRL2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
JrklB2RRL2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
JrklB2RRL2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
JrklB2RRL2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
JrklB2RRL2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
JrklB2RRL2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
JrklB2RRL2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
JrklB2RRL2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
JrklB2RRL2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
JrklB2RRL2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
JrklB2RRL2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
JrklB2RRL2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
JrklB2RRL2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
JrklB2RRL2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
JrklB2RRL2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
JrklB2RRL2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
JrklB2RRL2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
JrklB2RRL2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
JrklB2RRL2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
JrklB2RRL2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
JrklB2RRL2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
JrklB2RRL2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
JrklB2RRL2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
JrklB2RRL2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
JrklB2RRL2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
JrklB2RRL2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
JrklB2RRL2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
JrklB2RRL2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
JrklB2RRL2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
JrklB2RRL2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
JrklB2RRL2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
JrklB2RRL2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
JrklB2RRL2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
JrklB2RRL2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
JrklB2RRL2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
JrklB2RRL2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
JrklB2RRL2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
JrklB2RRL2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
JrklB2RRL2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
JrklB2RRL2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
JrklB2RRL2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
JrklB2RRL2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
JrklB2RRL2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
JrklB2RRL2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms