Protein–RNA interactions for Protein: B2RQE8

Arhgap42, Rho GTPase-activating protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap42B2RQE8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Arhgap42B2RQE8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Arhgap42B2RQE8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Arhgap42B2RQE8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Arhgap42B2RQE8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Arhgap42B2RQE8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Arhgap42B2RQE8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Arhgap42B2RQE8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Arhgap42B2RQE8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Arhgap42B2RQE8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Arhgap42B2RQE8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Arhgap42B2RQE8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Arhgap42B2RQE8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arhgap42B2RQE8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Arhgap42B2RQE8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Arhgap42B2RQE8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Arhgap42B2RQE8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Arhgap42B2RQE8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arhgap42B2RQE8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arhgap42B2RQE8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arhgap42B2RQE8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arhgap42B2RQE8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arhgap42B2RQE8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arhgap42B2RQE8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arhgap42B2RQE8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arhgap42B2RQE8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arhgap42B2RQE8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Arhgap42B2RQE8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Arhgap42B2RQE8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Arhgap42B2RQE8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Arhgap42B2RQE8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Arhgap42B2RQE8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Arhgap42B2RQE8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Arhgap42B2RQE8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Arhgap42B2RQE8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Arhgap42B2RQE8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Arhgap42B2RQE8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Arhgap42B2RQE8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Arhgap42B2RQE8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Arhgap42B2RQE8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Arhgap42B2RQE8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Arhgap42B2RQE8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Arhgap42B2RQE8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Arhgap42B2RQE8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Arhgap42B2RQE8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Arhgap42B2RQE8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Arhgap42B2RQE8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Arhgap42B2RQE8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Arhgap42B2RQE8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Arhgap42B2RQE8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Arhgap42B2RQE8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Arhgap42B2RQE8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Arhgap42B2RQE8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Arhgap42B2RQE8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Arhgap42B2RQE8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Arhgap42B2RQE8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Arhgap42B2RQE8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Arhgap42B2RQE8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Arhgap42B2RQE8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Arhgap42B2RQE8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Arhgap42B2RQE8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Arhgap42B2RQE8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Arhgap42B2RQE8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Arhgap42B2RQE8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Arhgap42B2RQE8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Arhgap42B2RQE8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Arhgap42B2RQE8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Arhgap42B2RQE8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Arhgap42B2RQE8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Arhgap42B2RQE8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Arhgap42B2RQE8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arhgap42B2RQE8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Arhgap42B2RQE8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arhgap42B2RQE8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arhgap42B2RQE8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Arhgap42B2RQE8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Arhgap42B2RQE8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Arhgap42B2RQE8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Arhgap42B2RQE8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Arhgap42B2RQE8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Arhgap42B2RQE8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Arhgap42B2RQE8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Arhgap42B2RQE8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Arhgap42B2RQE8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Arhgap42B2RQE8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Arhgap42B2RQE8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Arhgap42B2RQE8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Arhgap42B2RQE8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Arhgap42B2RQE8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Arhgap42B2RQE8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Arhgap42B2RQE8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Arhgap42B2RQE8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Arhgap42B2RQE8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Arhgap42B2RQE8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Arhgap42B2RQE8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Arhgap42B2RQE8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Arhgap42B2RQE8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Arhgap42B2RQE8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Arhgap42B2RQE8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Arhgap42B2RQE8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms