Protein–RNA interactions for Protein: B1AX35

1700011M02Rik, RIKEN cDNA 1700011M02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700011M02RikB1AX35 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
1700011M02RikB1AX35 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
1700011M02RikB1AX35 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700011M02RikB1AX35 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700011M02RikB1AX35 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700011M02RikB1AX35 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
1700011M02RikB1AX35 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700011M02RikB1AX35 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700011M02RikB1AX35 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700011M02RikB1AX35 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
1700011M02RikB1AX35 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700011M02RikB1AX35 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700011M02RikB1AX35 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700011M02RikB1AX35 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700011M02RikB1AX35 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700011M02RikB1AX35 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700011M02RikB1AX35 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700011M02RikB1AX35 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700011M02RikB1AX35 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700011M02RikB1AX35 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700011M02RikB1AX35 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700011M02RikB1AX35 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700011M02RikB1AX35 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700011M02RikB1AX35 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700011M02RikB1AX35 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700011M02RikB1AX35 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700011M02RikB1AX35 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700011M02RikB1AX35 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700011M02RikB1AX35 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700011M02RikB1AX35 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700011M02RikB1AX35 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700011M02RikB1AX35 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
1700011M02RikB1AX35 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700011M02RikB1AX35 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700011M02RikB1AX35 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700011M02RikB1AX35 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700011M02RikB1AX35 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700011M02RikB1AX35 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700011M02RikB1AX35 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700011M02RikB1AX35 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700011M02RikB1AX35 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
1700011M02RikB1AX35 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700011M02RikB1AX35 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700011M02RikB1AX35 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700011M02RikB1AX35 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700011M02RikB1AX35 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
1700011M02RikB1AX35 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700011M02RikB1AX35 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700011M02RikB1AX35 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700011M02RikB1AX35 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700011M02RikB1AX35 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700011M02RikB1AX35 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700011M02RikB1AX35 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700011M02RikB1AX35 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700011M02RikB1AX35 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700011M02RikB1AX35 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700011M02RikB1AX35 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700011M02RikB1AX35 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700011M02RikB1AX35 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700011M02RikB1AX35 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700011M02RikB1AX35 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700011M02RikB1AX35 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700011M02RikB1AX35 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700011M02RikB1AX35 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700011M02RikB1AX35 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700011M02RikB1AX35 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700011M02RikB1AX35 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
1700011M02RikB1AX35 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700011M02RikB1AX35 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700011M02RikB1AX35 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700011M02RikB1AX35 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700011M02RikB1AX35 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700011M02RikB1AX35 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700011M02RikB1AX35 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700011M02RikB1AX35 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700011M02RikB1AX35 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700011M02RikB1AX35 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700011M02RikB1AX35 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700011M02RikB1AX35 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700011M02RikB1AX35 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700011M02RikB1AX35 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700011M02RikB1AX35 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700011M02RikB1AX35 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700011M02RikB1AX35 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700011M02RikB1AX35 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700011M02RikB1AX35 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700011M02RikB1AX35 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700011M02RikB1AX35 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700011M02RikB1AX35 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700011M02RikB1AX35 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700011M02RikB1AX35 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700011M02RikB1AX35 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700011M02RikB1AX35 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700011M02RikB1AX35 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700011M02RikB1AX35 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700011M02RikB1AX35 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700011M02RikB1AX35 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700011M02RikB1AX35 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700011M02RikB1AX35 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700011M02RikB1AX35 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms