Protein–RNA interactions for Protein: B1AT01

1700084M14Rik, RIKEN cDNA 1700084M14 gene, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700084M14RikB1AT01 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700084M14RikB1AT01 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
1700084M14RikB1AT01 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
1700084M14RikB1AT01 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
1700084M14RikB1AT01 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
1700084M14RikB1AT01 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700084M14RikB1AT01 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700084M14RikB1AT01 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700084M14RikB1AT01 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
1700084M14RikB1AT01 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
1700084M14RikB1AT01 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
1700084M14RikB1AT01 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
1700084M14RikB1AT01 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
1700084M14RikB1AT01 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
1700084M14RikB1AT01 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
1700084M14RikB1AT01 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1700084M14RikB1AT01 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1700084M14RikB1AT01 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1700084M14RikB1AT01 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
1700084M14RikB1AT01 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
1700084M14RikB1AT01 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
1700084M14RikB1AT01 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
1700084M14RikB1AT01 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
1700084M14RikB1AT01 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
1700084M14RikB1AT01 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
1700084M14RikB1AT01 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1700084M14RikB1AT01 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1700084M14RikB1AT01 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700084M14RikB1AT01 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700084M14RikB1AT01 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1700084M14RikB1AT01 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1700084M14RikB1AT01 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700084M14RikB1AT01 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
1700084M14RikB1AT01 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700084M14RikB1AT01 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700084M14RikB1AT01 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700084M14RikB1AT01 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700084M14RikB1AT01 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700084M14RikB1AT01 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700084M14RikB1AT01 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700084M14RikB1AT01 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
1700084M14RikB1AT01 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700084M14RikB1AT01 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700084M14RikB1AT01 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700084M14RikB1AT01 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
1700084M14RikB1AT01 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700084M14RikB1AT01 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700084M14RikB1AT01 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700084M14RikB1AT01 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700084M14RikB1AT01 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700084M14RikB1AT01 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700084M14RikB1AT01 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700084M14RikB1AT01 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700084M14RikB1AT01 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700084M14RikB1AT01 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
1700084M14RikB1AT01 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
1700084M14RikB1AT01 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1700084M14RikB1AT01 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
1700084M14RikB1AT01 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1700084M14RikB1AT01 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
1700084M14RikB1AT01 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1700084M14RikB1AT01 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1700084M14RikB1AT01 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1700084M14RikB1AT01 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
1700084M14RikB1AT01 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
1700084M14RikB1AT01 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
1700084M14RikB1AT01 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700084M14RikB1AT01 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700084M14RikB1AT01 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700084M14RikB1AT01 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700084M14RikB1AT01 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700084M14RikB1AT01 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
1700084M14RikB1AT01 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700084M14RikB1AT01 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700084M14RikB1AT01 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700084M14RikB1AT01 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700084M14RikB1AT01 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700084M14RikB1AT01 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700084M14RikB1AT01 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
1700084M14RikB1AT01 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
1700084M14RikB1AT01 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700084M14RikB1AT01 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700084M14RikB1AT01 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700084M14RikB1AT01 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
1700084M14RikB1AT01 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
1700084M14RikB1AT01 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700084M14RikB1AT01 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700084M14RikB1AT01 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700084M14RikB1AT01 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700084M14RikB1AT01 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700084M14RikB1AT01 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700084M14RikB1AT01 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700084M14RikB1AT01 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700084M14RikB1AT01 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
1700084M14RikB1AT01 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
1700084M14RikB1AT01 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
1700084M14RikB1AT01 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
1700084M14RikB1AT01 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
1700084M14RikB1AT01 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
1700084M14RikB1AT01 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.9 ms