Protein–RNA interactions for Protein: A7XV07

Skint8, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint8A7XV07 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Skint8A7XV07 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Skint8A7XV07 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Skint8A7XV07 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Skint8A7XV07 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Skint8A7XV07 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Skint8A7XV07 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Skint8A7XV07 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Skint8A7XV07 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Skint8A7XV07 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Skint8A7XV07 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Skint8A7XV07 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Skint8A7XV07 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Skint8A7XV07 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Skint8A7XV07 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Skint8A7XV07 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Skint8A7XV07 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Skint8A7XV07 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Skint8A7XV07 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Skint8A7XV07 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Skint8A7XV07 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Skint8A7XV07 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Skint8A7XV07 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Skint8A7XV07 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Skint8A7XV07 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Skint8A7XV07 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Skint8A7XV07 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Skint8A7XV07 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Skint8A7XV07 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Skint8A7XV07 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Skint8A7XV07 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Skint8A7XV07 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Skint8A7XV07 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Skint8A7XV07 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Skint8A7XV07 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Skint8A7XV07 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Skint8A7XV07 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Skint8A7XV07 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Skint8A7XV07 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Skint8A7XV07 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Skint8A7XV07 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Skint8A7XV07 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Skint8A7XV07 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Skint8A7XV07 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Skint8A7XV07 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Skint8A7XV07 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Skint8A7XV07 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Skint8A7XV07 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Skint8A7XV07 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Skint8A7XV07 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Skint8A7XV07 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Skint8A7XV07 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Skint8A7XV07 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Skint8A7XV07 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Skint8A7XV07 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Skint8A7XV07 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Skint8A7XV07 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Skint8A7XV07 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Skint8A7XV07 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Skint8A7XV07 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Skint8A7XV07 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Skint8A7XV07 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Skint8A7XV07 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Skint8A7XV07 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Skint8A7XV07 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Skint8A7XV07 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Skint8A7XV07 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Skint8A7XV07 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Skint8A7XV07 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Skint8A7XV07 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Skint8A7XV07 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Skint8A7XV07 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Skint8A7XV07 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Skint8A7XV07 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Skint8A7XV07 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Skint8A7XV07 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Skint8A7XV07 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Skint8A7XV07 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Skint8A7XV07 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Skint8A7XV07 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Skint8A7XV07 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Skint8A7XV07 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Skint8A7XV07 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Skint8A7XV07 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Skint8A7XV07 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Skint8A7XV07 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Skint8A7XV07 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Skint8A7XV07 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Skint8A7XV07 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Skint8A7XV07 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Skint8A7XV07 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Skint8A7XV07 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Skint8A7XV07 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Skint8A7XV07 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Skint8A7XV07 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Skint8A7XV07 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Skint8A7XV07 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Skint8A7XV07 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Skint8A7XV07 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Skint8A7XV07 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms