Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-M5A7VMS3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-M5A7VMS3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-M5A7VMS3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-M5A7VMS3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-M5A7VMS3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-M5A7VMS3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-M5A7VMS3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-M5A7VMS3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-M5A7VMS3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-M5A7VMS3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-M5A7VMS3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-M5A7VMS3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-M5A7VMS3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-M5A7VMS3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-M5A7VMS3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-M5A7VMS3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-M5A7VMS3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-M5A7VMS3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-M5A7VMS3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-M5A7VMS3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-M5A7VMS3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-M5A7VMS3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-M5A7VMS3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-M5A7VMS3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-M5A7VMS3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-M5A7VMS3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-M5A7VMS3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-M5A7VMS3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-M5A7VMS3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-M5A7VMS3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-M5A7VMS3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-M5A7VMS3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-M5A7VMS3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-M5A7VMS3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-M5A7VMS3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-M5A7VMS3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-M5A7VMS3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
H2-M5A7VMS3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
H2-M5A7VMS3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
H2-M5A7VMS3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
H2-M5A7VMS3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-M5A7VMS3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-M5A7VMS3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-M5A7VMS3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-M5A7VMS3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-M5A7VMS3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-M5A7VMS3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-M5A7VMS3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-M5A7VMS3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-M5A7VMS3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-M5A7VMS3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-M5A7VMS3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-M5A7VMS3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-M5A7VMS3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-M5A7VMS3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-M5A7VMS3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-M5A7VMS3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-M5A7VMS3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-M5A7VMS3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-M5A7VMS3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-M5A7VMS3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-M5A7VMS3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-M5A7VMS3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-M5A7VMS3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
H2-M5A7VMS3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
H2-M5A7VMS3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
H2-M5A7VMS3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
H2-M5A7VMS3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
H2-M5A7VMS3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
H2-M5A7VMS3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2-M5A7VMS3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2-M5A7VMS3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
H2-M5A7VMS3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2-M5A7VMS3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-M5A7VMS3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-M5A7VMS3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-M5A7VMS3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-M5A7VMS3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-M5A7VMS3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-M5A7VMS3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2-M5A7VMS3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2-M5A7VMS3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2-M5A7VMS3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
H2-M5A7VMS3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2-M5A7VMS3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2-M5A7VMS3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2-M5A7VMS3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2-M5A7VMS3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2-M5A7VMS3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2-M5A7VMS3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2-M5A7VMS3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2-M5A7VMS3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2-M5A7VMS3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2-M5A7VMS3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
H2-M5A7VMS3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2-M5A7VMS3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2-M5A7VMS3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
H2-M5A7VMS3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
H2-M5A7VMS3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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