Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm3173A6NAS3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm3173A6NAS3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm3173A6NAS3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm3173A6NAS3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm3173A6NAS3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm3173A6NAS3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm3173A6NAS3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm3173A6NAS3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm3173A6NAS3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm3173A6NAS3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm3173A6NAS3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm3173A6NAS3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm3173A6NAS3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm3173A6NAS3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm3173A6NAS3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm3173A6NAS3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm3173A6NAS3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm3173A6NAS3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm3173A6NAS3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm3173A6NAS3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm3173A6NAS3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm3173A6NAS3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm3173A6NAS3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm3173A6NAS3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm3173A6NAS3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm3173A6NAS3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm3173A6NAS3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm3173A6NAS3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm3173A6NAS3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm3173A6NAS3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm3173A6NAS3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm3173A6NAS3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm3173A6NAS3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm3173A6NAS3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm3173A6NAS3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm3173A6NAS3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm3173A6NAS3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm3173A6NAS3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3173A6NAS3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3173A6NAS3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3173A6NAS3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3173A6NAS3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3173A6NAS3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm3173A6NAS3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm3173A6NAS3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm3173A6NAS3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm3173A6NAS3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm3173A6NAS3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm3173A6NAS3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm3173A6NAS3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm3173A6NAS3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm3173A6NAS3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm3173A6NAS3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm3173A6NAS3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm3173A6NAS3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm3173A6NAS3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm3173A6NAS3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm3173A6NAS3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm3173A6NAS3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm3173A6NAS3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm3173A6NAS3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm3173A6NAS3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm3173A6NAS3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm3173A6NAS3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm3173A6NAS3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm3173A6NAS3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm3173A6NAS3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm3173A6NAS3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm3173A6NAS3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm3173A6NAS3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm3173A6NAS3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm3173A6NAS3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm3173A6NAS3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm3173A6NAS3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm3173A6NAS3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm3173A6NAS3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm3173A6NAS3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm3173A6NAS3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm3173A6NAS3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm3173A6NAS3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm3173A6NAS3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm3173A6NAS3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm3173A6NAS3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm3173A6NAS3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm3173A6NAS3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm3173A6NAS3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm3173A6NAS3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm3173A6NAS3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm3173A6NAS3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm3173A6NAS3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm3173A6NAS3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm3173A6NAS3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm3173A6NAS3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm3173A6NAS3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm3173A6NAS3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm3173A6NAS3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm3173A6NAS3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm3173A6NAS3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm3173A6NAS3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 219.3 ms