Protein–RNA interactions for Protein: A2ART4

Gm2026, Novel KRAB box and zinc finger, C2H2 type domain containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2026A2ART4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm2026A2ART4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm2026A2ART4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm2026A2ART4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm2026A2ART4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm2026A2ART4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm2026A2ART4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm2026A2ART4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm2026A2ART4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm2026A2ART4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm2026A2ART4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm2026A2ART4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm2026A2ART4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm2026A2ART4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm2026A2ART4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm2026A2ART4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm2026A2ART4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm2026A2ART4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm2026A2ART4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm2026A2ART4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm2026A2ART4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm2026A2ART4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm2026A2ART4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm2026A2ART4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm2026A2ART4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm2026A2ART4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm2026A2ART4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm2026A2ART4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm2026A2ART4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm2026A2ART4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm2026A2ART4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm2026A2ART4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm2026A2ART4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm2026A2ART4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm2026A2ART4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm2026A2ART4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm2026A2ART4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm2026A2ART4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm2026A2ART4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm2026A2ART4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm2026A2ART4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm2026A2ART4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm2026A2ART4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm2026A2ART4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm2026A2ART4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm2026A2ART4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gm2026A2ART4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm2026A2ART4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm2026A2ART4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm2026A2ART4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm2026A2ART4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm2026A2ART4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm2026A2ART4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm2026A2ART4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm2026A2ART4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm2026A2ART4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm2026A2ART4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm2026A2ART4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm2026A2ART4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm2026A2ART4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm2026A2ART4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm2026A2ART4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm2026A2ART4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm2026A2ART4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm2026A2ART4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm2026A2ART4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm2026A2ART4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm2026A2ART4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm2026A2ART4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm2026A2ART4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm2026A2ART4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm2026A2ART4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm2026A2ART4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm2026A2ART4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm2026A2ART4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm2026A2ART4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm2026A2ART4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm2026A2ART4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm2026A2ART4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm2026A2ART4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm2026A2ART4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm2026A2ART4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm2026A2ART4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm2026A2ART4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm2026A2ART4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm2026A2ART4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm2026A2ART4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm2026A2ART4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm2026A2ART4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm2026A2ART4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm2026A2ART4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm2026A2ART4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm2026A2ART4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm2026A2ART4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm2026A2ART4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm2026A2ART4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm2026A2ART4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm2026A2ART4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm2026A2ART4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm2026A2ART4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms