Protein–RNA interactions for Protein: A2ARP9

Catsper2, Cation channel sperm-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper2A2ARP9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Catsper2A2ARP9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Catsper2A2ARP9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Catsper2A2ARP9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Catsper2A2ARP9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Catsper2A2ARP9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Catsper2A2ARP9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Catsper2A2ARP9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Catsper2A2ARP9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Catsper2A2ARP9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Catsper2A2ARP9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Catsper2A2ARP9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Catsper2A2ARP9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Catsper2A2ARP9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Catsper2A2ARP9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Catsper2A2ARP9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Catsper2A2ARP9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Catsper2A2ARP9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Catsper2A2ARP9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Catsper2A2ARP9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Catsper2A2ARP9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Catsper2A2ARP9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Catsper2A2ARP9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Catsper2A2ARP9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Catsper2A2ARP9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Catsper2A2ARP9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Catsper2A2ARP9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Catsper2A2ARP9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Catsper2A2ARP9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Catsper2A2ARP9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Catsper2A2ARP9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Catsper2A2ARP9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Catsper2A2ARP9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Catsper2A2ARP9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Catsper2A2ARP9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Catsper2A2ARP9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Catsper2A2ARP9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Catsper2A2ARP9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Catsper2A2ARP9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Catsper2A2ARP9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Catsper2A2ARP9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Catsper2A2ARP9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Catsper2A2ARP9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Catsper2A2ARP9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Catsper2A2ARP9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Catsper2A2ARP9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Catsper2A2ARP9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Catsper2A2ARP9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Catsper2A2ARP9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Catsper2A2ARP9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Catsper2A2ARP9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Catsper2A2ARP9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Catsper2A2ARP9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Catsper2A2ARP9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Catsper2A2ARP9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Catsper2A2ARP9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Catsper2A2ARP9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Catsper2A2ARP9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Catsper2A2ARP9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Catsper2A2ARP9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Catsper2A2ARP9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Catsper2A2ARP9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Catsper2A2ARP9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Catsper2A2ARP9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Catsper2A2ARP9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Catsper2A2ARP9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Catsper2A2ARP9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Catsper2A2ARP9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Catsper2A2ARP9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Catsper2A2ARP9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Catsper2A2ARP9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Catsper2A2ARP9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Catsper2A2ARP9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Catsper2A2ARP9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Catsper2A2ARP9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Catsper2A2ARP9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Catsper2A2ARP9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Catsper2A2ARP9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Catsper2A2ARP9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Catsper2A2ARP9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Catsper2A2ARP9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Catsper2A2ARP9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Catsper2A2ARP9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Catsper2A2ARP9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Catsper2A2ARP9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Catsper2A2ARP9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Catsper2A2ARP9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Catsper2A2ARP9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Catsper2A2ARP9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Catsper2A2ARP9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Catsper2A2ARP9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Catsper2A2ARP9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Catsper2A2ARP9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Catsper2A2ARP9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Catsper2A2ARP9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Catsper2A2ARP9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Catsper2A2ARP9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Catsper2A2ARP9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Catsper2A2ARP9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Catsper2A2ARP9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms