Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SetxA2AKX3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SetxA2AKX3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SetxA2AKX3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SetxA2AKX3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SetxA2AKX3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SetxA2AKX3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SetxA2AKX3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SetxA2AKX3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SetxA2AKX3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SetxA2AKX3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SetxA2AKX3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SetxA2AKX3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SetxA2AKX3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SetxA2AKX3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SetxA2AKX3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SetxA2AKX3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SetxA2AKX3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SetxA2AKX3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SetxA2AKX3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SetxA2AKX3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SetxA2AKX3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SetxA2AKX3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SetxA2AKX3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SetxA2AKX3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SetxA2AKX3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SetxA2AKX3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SetxA2AKX3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SetxA2AKX3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SetxA2AKX3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SetxA2AKX3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SetxA2AKX3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SetxA2AKX3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SetxA2AKX3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SetxA2AKX3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SetxA2AKX3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SetxA2AKX3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SetxA2AKX3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SetxA2AKX3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SetxA2AKX3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SetxA2AKX3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SetxA2AKX3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SetxA2AKX3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SetxA2AKX3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SetxA2AKX3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SetxA2AKX3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SetxA2AKX3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SetxA2AKX3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SetxA2AKX3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SetxA2AKX3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SetxA2AKX3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SetxA2AKX3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SetxA2AKX3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SetxA2AKX3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SetxA2AKX3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SetxA2AKX3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SetxA2AKX3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SetxA2AKX3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SetxA2AKX3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SetxA2AKX3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SetxA2AKX3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SetxA2AKX3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SetxA2AKX3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SetxA2AKX3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SetxA2AKX3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SetxA2AKX3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SetxA2AKX3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SetxA2AKX3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SetxA2AKX3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SetxA2AKX3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SetxA2AKX3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SetxA2AKX3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SetxA2AKX3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SetxA2AKX3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SetxA2AKX3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SetxA2AKX3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SetxA2AKX3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SetxA2AKX3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SetxA2AKX3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SetxA2AKX3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SetxA2AKX3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SetxA2AKX3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SetxA2AKX3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SetxA2AKX3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SetxA2AKX3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SetxA2AKX3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SetxA2AKX3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SetxA2AKX3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SetxA2AKX3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SetxA2AKX3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SetxA2AKX3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SetxA2AKX3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SetxA2AKX3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SetxA2AKX3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SetxA2AKX3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SetxA2AKX3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SetxA2AKX3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SetxA2AKX3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SetxA2AKX3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SetxA2AKX3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms