Protein–RNA interactions for Protein: A2A6T1

Cdr2l, Cerebellar degeneration-related protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr2lA2A6T1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdr2lA2A6T1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdr2lA2A6T1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdr2lA2A6T1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdr2lA2A6T1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cdr2lA2A6T1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Cdr2lA2A6T1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cdr2lA2A6T1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdr2lA2A6T1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdr2lA2A6T1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdr2lA2A6T1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdr2lA2A6T1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdr2lA2A6T1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdr2lA2A6T1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdr2lA2A6T1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdr2lA2A6T1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdr2lA2A6T1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdr2lA2A6T1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdr2lA2A6T1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdr2lA2A6T1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdr2lA2A6T1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdr2lA2A6T1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdr2lA2A6T1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdr2lA2A6T1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdr2lA2A6T1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdr2lA2A6T1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdr2lA2A6T1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdr2lA2A6T1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdr2lA2A6T1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdr2lA2A6T1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdr2lA2A6T1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdr2lA2A6T1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdr2lA2A6T1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdr2lA2A6T1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdr2lA2A6T1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdr2lA2A6T1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Cdr2lA2A6T1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdr2lA2A6T1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdr2lA2A6T1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdr2lA2A6T1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdr2lA2A6T1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdr2lA2A6T1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdr2lA2A6T1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cdr2lA2A6T1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cdr2lA2A6T1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cdr2lA2A6T1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdr2lA2A6T1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdr2lA2A6T1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdr2lA2A6T1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdr2lA2A6T1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdr2lA2A6T1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdr2lA2A6T1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdr2lA2A6T1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdr2lA2A6T1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdr2lA2A6T1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdr2lA2A6T1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdr2lA2A6T1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdr2lA2A6T1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdr2lA2A6T1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cdr2lA2A6T1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cdr2lA2A6T1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cdr2lA2A6T1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cdr2lA2A6T1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdr2lA2A6T1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdr2lA2A6T1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdr2lA2A6T1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdr2lA2A6T1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdr2lA2A6T1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdr2lA2A6T1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdr2lA2A6T1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdr2lA2A6T1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdr2lA2A6T1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdr2lA2A6T1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdr2lA2A6T1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdr2lA2A6T1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdr2lA2A6T1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdr2lA2A6T1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdr2lA2A6T1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cdr2lA2A6T1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdr2lA2A6T1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdr2lA2A6T1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdr2lA2A6T1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdr2lA2A6T1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdr2lA2A6T1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdr2lA2A6T1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdr2lA2A6T1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdr2lA2A6T1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdr2lA2A6T1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdr2lA2A6T1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdr2lA2A6T1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdr2lA2A6T1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdr2lA2A6T1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdr2lA2A6T1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdr2lA2A6T1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdr2lA2A6T1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdr2lA2A6T1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdr2lA2A6T1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdr2lA2A6T1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdr2lA2A6T1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdr2lA2A6T1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms