Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Calcoco2A2A6M5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Calcoco2A2A6M5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Calcoco2A2A6M5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Calcoco2A2A6M5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Calcoco2A2A6M5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Calcoco2A2A6M5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Calcoco2A2A6M5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Calcoco2A2A6M5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Calcoco2A2A6M5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Calcoco2A2A6M5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Calcoco2A2A6M5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Calcoco2A2A6M5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Calcoco2A2A6M5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Calcoco2A2A6M5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Calcoco2A2A6M5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Calcoco2A2A6M5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Calcoco2A2A6M5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Calcoco2A2A6M5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Calcoco2A2A6M5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Calcoco2A2A6M5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Calcoco2A2A6M5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Calcoco2A2A6M5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Calcoco2A2A6M5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Calcoco2A2A6M5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Calcoco2A2A6M5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Calcoco2A2A6M5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Calcoco2A2A6M5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Calcoco2A2A6M5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Calcoco2A2A6M5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Calcoco2A2A6M5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Calcoco2A2A6M5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Calcoco2A2A6M5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Calcoco2A2A6M5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Calcoco2A2A6M5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Calcoco2A2A6M5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Calcoco2A2A6M5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Calcoco2A2A6M5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Calcoco2A2A6M5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Calcoco2A2A6M5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Calcoco2A2A6M5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Calcoco2A2A6M5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Calcoco2A2A6M5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Calcoco2A2A6M5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Calcoco2A2A6M5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Calcoco2A2A6M5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Calcoco2A2A6M5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Calcoco2A2A6M5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Calcoco2A2A6M5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Calcoco2A2A6M5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Calcoco2A2A6M5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Calcoco2A2A6M5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Calcoco2A2A6M5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Calcoco2A2A6M5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Calcoco2A2A6M5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Calcoco2A2A6M5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Calcoco2A2A6M5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Calcoco2A2A6M5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Calcoco2A2A6M5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Calcoco2A2A6M5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Calcoco2A2A6M5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Calcoco2A2A6M5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Calcoco2A2A6M5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Calcoco2A2A6M5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Calcoco2A2A6M5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Calcoco2A2A6M5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Calcoco2A2A6M5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Calcoco2A2A6M5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Calcoco2A2A6M5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Calcoco2A2A6M5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Calcoco2A2A6M5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Calcoco2A2A6M5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Calcoco2A2A6M5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Calcoco2A2A6M5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Calcoco2A2A6M5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Calcoco2A2A6M5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Calcoco2A2A6M5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Calcoco2A2A6M5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Calcoco2A2A6M5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Calcoco2A2A6M5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Calcoco2A2A6M5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Calcoco2A2A6M5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Calcoco2A2A6M5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Calcoco2A2A6M5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Calcoco2A2A6M5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Calcoco2A2A6M5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Calcoco2A2A6M5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Calcoco2A2A6M5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Calcoco2A2A6M5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Calcoco2A2A6M5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Calcoco2A2A6M5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Calcoco2A2A6M5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Calcoco2A2A6M5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Calcoco2A2A6M5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Calcoco2A2A6M5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Calcoco2A2A6M5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Calcoco2A2A6M5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Calcoco2A2A6M5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Calcoco2A2A6M5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Calcoco2A2A6M5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms