Protein–RNA interactions for Protein: A1L317

Krt24, Keratin, type I cytoskeletal 24, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt24A1L317 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28,76■■■□□ 2,19
Krt24A1L317 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Krt24A1L317 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Krt24A1L317 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28,75■■■□□ 2,19
Krt24A1L317 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Krt24A1L317 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Krt24A1L317 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28,74■■■□□ 2,19
Krt24A1L317 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Krt24A1L317 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Krt24A1L317 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Krt24A1L317 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Krt24A1L317 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,71■■■□□ 2,19
Krt24A1L317 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Krt24A1L317 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Krt24A1L317 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,69■■■□□ 2,18
Krt24A1L317 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Krt24A1L317 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Krt24A1L317 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28,68■■■□□ 2,18
Krt24A1L317 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Krt24A1L317 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28,67■■■□□ 2,18
Krt24A1L317 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,67■■■□□ 2,18
Krt24A1L317 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28,67■■■□□ 2,18
Krt24A1L317 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Krt24A1L317 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28,66■■■□□ 2,18
Krt24A1L317 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28,66■■■□□ 2,18
Krt24A1L317 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Krt24A1L317 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Krt24A1L317 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,17
Krt24A1L317 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Krt24A1L317 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28,61■■■□□ 2,17
Krt24A1L317 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28,61■■■□□ 2,17
Krt24A1L317 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Krt24A1L317 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Krt24A1L317 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28,61■■■□□ 2,17
Krt24A1L317 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28,6■■■□□ 2,17
Krt24A1L317 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,6■■■□□ 2,17
Krt24A1L317 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Krt24A1L317 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Krt24A1L317 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Krt24A1L317 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28,57■■■□□ 2,16
Krt24A1L317 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28,57■■■□□ 2,16
Krt24A1L317 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Krt24A1L317 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,55■■■□□ 2,16
Krt24A1L317 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Krt24A1L317 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Krt24A1L317 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28,52■■■□□ 2,16
Krt24A1L317 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28,52■■■□□ 2,16
Krt24A1L317 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Krt24A1L317 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Krt24A1L317 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Krt24A1L317 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Krt24A1L317 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Krt24A1L317 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Krt24A1L317 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Krt24A1L317 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Krt24A1L317 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Krt24A1L317 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Krt24A1L317 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Krt24A1L317 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Krt24A1L317 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28,46■■■□□ 2,15
Krt24A1L317 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28,46■■■□□ 2,15
Krt24A1L317 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Krt24A1L317 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Krt24A1L317 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,15
Krt24A1L317 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28,45■■■□□ 2,14
Krt24A1L317 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Krt24A1L317 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,44■■■□□ 2,14
Krt24A1L317 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,43■■■□□ 2,14
Krt24A1L317 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Krt24A1L317 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Krt24A1L317 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Krt24A1L317 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,41■■■□□ 2,14
Krt24A1L317 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Krt24A1L317 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Krt24A1L317 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Krt24A1L317 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Krt24A1L317 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28,38■■■□□ 2,13
Krt24A1L317 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Krt24A1L317 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Krt24A1L317 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Krt24A1L317 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Krt24A1L317 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Krt24A1L317 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Krt24A1L317 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,34■■■□□ 2,13
Krt24A1L317 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Krt24A1L317 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Krt24A1L317 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Krt24A1L317 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,33■■■□□ 2,13
Krt24A1L317 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Krt24A1L317 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Krt24A1L317 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28,32■■■□□ 2,12
Krt24A1L317 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Krt24A1L317 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Krt24A1L317 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Krt24A1L317 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28,3■■■□□ 2,12
Krt24A1L317 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Krt24A1L317 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Krt24A1L317 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28,29■■■□□ 2,12
Krt24A1L317 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28,29■■■□□ 2,12
Krt24A1L317 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37,2 ms