Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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