Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YU88

Gm3147, Predicted gene 3147, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3147A0A0J9YU88 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3147A0A0J9YU88 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3147A0A0J9YU88 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3147A0A0J9YU88 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3147A0A0J9YU88 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3147A0A0J9YU88 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3147A0A0J9YU88 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3147A0A0J9YU88 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3147A0A0J9YU88 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3147A0A0J9YU88 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3147A0A0J9YU88 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3147A0A0J9YU88 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm3147A0A0J9YU88 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm3147A0A0J9YU88 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm3147A0A0J9YU88 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3147A0A0J9YU88 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3147A0A0J9YU88 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3147A0A0J9YU88 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3147A0A0J9YU88 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3147A0A0J9YU88 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3147A0A0J9YU88 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3147A0A0J9YU88 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3147A0A0J9YU88 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3147A0A0J9YU88 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3147A0A0J9YU88 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3147A0A0J9YU88 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3147A0A0J9YU88 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3147A0A0J9YU88 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3147A0A0J9YU88 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3147A0A0J9YU88 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3147A0A0J9YU88 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3147A0A0J9YU88 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3147A0A0J9YU88 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3147A0A0J9YU88 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3147A0A0J9YU88 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3147A0A0J9YU88 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3147A0A0J9YU88 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3147A0A0J9YU88 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3147A0A0J9YU88 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3147A0A0J9YU88 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3147A0A0J9YU88 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3147A0A0J9YU88 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3147A0A0J9YU88 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3147A0A0J9YU88 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Gm3147A0A0J9YU88 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3147A0A0J9YU88 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3147A0A0J9YU88 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3147A0A0J9YU88 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3147A0A0J9YU88 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3147A0A0J9YU88 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3147A0A0J9YU88 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3147A0A0J9YU88 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3147A0A0J9YU88 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3147A0A0J9YU88 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3147A0A0J9YU88 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3147A0A0J9YU88 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3147A0A0J9YU88 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3147A0A0J9YU88 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3147A0A0J9YU88 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3147A0A0J9YU88 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3147A0A0J9YU88 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm3147A0A0J9YU88 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm3147A0A0J9YU88 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm3147A0A0J9YU88 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm3147A0A0J9YU88 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm3147A0A0J9YU88 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3147A0A0J9YU88 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3147A0A0J9YU88 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3147A0A0J9YU88 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3147A0A0J9YU88 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3147A0A0J9YU88 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3147A0A0J9YU88 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3147A0A0J9YU88 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3147A0A0J9YU88 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3147A0A0J9YU88 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3147A0A0J9YU88 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3147A0A0J9YU88 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3147A0A0J9YU88 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3147A0A0J9YU88 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3147A0A0J9YU88 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3147A0A0J9YU88 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3147A0A0J9YU88 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3147A0A0J9YU88 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3147A0A0J9YU88 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3147A0A0J9YU88 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3147A0A0J9YU88 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3147A0A0J9YU88 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3147A0A0J9YU88 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3147A0A0J9YU88 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3147A0A0J9YU88 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3147A0A0J9YU88 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3147A0A0J9YU88 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gm3147A0A0J9YU88 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3147A0A0J9YU88 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3147A0A0J9YU88 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3147A0A0J9YU88 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3147A0A0J9YU88 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3147A0A0J9YU88 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3147A0A0J9YU88 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3147A0A0J9YU88 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
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