Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXF1

Ighv3-4, Immunoglobulin heavy variable V3-4 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ighv3-4A0A0A6YXF1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ighv3-4A0A0A6YXF1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ighv3-4A0A0A6YXF1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ighv3-4A0A0A6YXF1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ighv3-4A0A0A6YXF1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ighv3-4A0A0A6YXF1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ighv3-4A0A0A6YXF1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ighv3-4A0A0A6YXF1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ighv3-4A0A0A6YXF1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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