Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WRU1

CN725425, cDNA sequence CN725425, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CN725425A0A087WRU1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CN725425A0A087WRU1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CN725425A0A087WRU1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CN725425A0A087WRU1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CN725425A0A087WRU1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CN725425A0A087WRU1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CN725425A0A087WRU1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CN725425A0A087WRU1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CN725425A0A087WRU1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CN725425A0A087WRU1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CN725425A0A087WRU1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CN725425A0A087WRU1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CN725425A0A087WRU1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CN725425A0A087WRU1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CN725425A0A087WRU1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CN725425A0A087WRU1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CN725425A0A087WRU1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CN725425A0A087WRU1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CN725425A0A087WRU1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CN725425A0A087WRU1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CN725425A0A087WRU1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CN725425A0A087WRU1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CN725425A0A087WRU1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CN725425A0A087WRU1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CN725425A0A087WRU1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CN725425A0A087WRU1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CN725425A0A087WRU1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CN725425A0A087WRU1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CN725425A0A087WRU1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CN725425A0A087WRU1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CN725425A0A087WRU1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CN725425A0A087WRU1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CN725425A0A087WRU1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CN725425A0A087WRU1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CN725425A0A087WRU1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CN725425A0A087WRU1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CN725425A0A087WRU1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CN725425A0A087WRU1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CN725425A0A087WRU1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CN725425A0A087WRU1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CN725425A0A087WRU1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CN725425A0A087WRU1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CN725425A0A087WRU1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CN725425A0A087WRU1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CN725425A0A087WRU1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CN725425A0A087WRU1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CN725425A0A087WRU1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CN725425A0A087WRU1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CN725425A0A087WRU1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CN725425A0A087WRU1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CN725425A0A087WRU1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CN725425A0A087WRU1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CN725425A0A087WRU1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CN725425A0A087WRU1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CN725425A0A087WRU1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CN725425A0A087WRU1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CN725425A0A087WRU1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CN725425A0A087WRU1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CN725425A0A087WRU1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CN725425A0A087WRU1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CN725425A0A087WRU1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CN725425A0A087WRU1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CN725425A0A087WRU1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CN725425A0A087WRU1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CN725425A0A087WRU1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CN725425A0A087WRU1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CN725425A0A087WRU1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CN725425A0A087WRU1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CN725425A0A087WRU1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CN725425A0A087WRU1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CN725425A0A087WRU1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CN725425A0A087WRU1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CN725425A0A087WRU1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CN725425A0A087WRU1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CN725425A0A087WRU1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CN725425A0A087WRU1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CN725425A0A087WRU1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CN725425A0A087WRU1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CN725425A0A087WRU1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CN725425A0A087WRU1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CN725425A0A087WRU1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CN725425A0A087WRU1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CN725425A0A087WRU1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CN725425A0A087WRU1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CN725425A0A087WRU1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CN725425A0A087WRU1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CN725425A0A087WRU1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CN725425A0A087WRU1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CN725425A0A087WRU1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CN725425A0A087WRU1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CN725425A0A087WRU1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CN725425A0A087WRU1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CN725425A0A087WRU1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CN725425A0A087WRU1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CN725425A0A087WRU1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CN725425A0A087WRU1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CN725425A0A087WRU1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CN725425A0A087WRU1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CN725425A0A087WRU1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CN725425A0A087WRU1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.8 ms