Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP35

Gm28919, Predicted gene 28919, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28919A0A087WP35 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm28919A0A087WP35 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm28919A0A087WP35 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm28919A0A087WP35 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm28919A0A087WP35 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm28919A0A087WP35 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm28919A0A087WP35 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm28919A0A087WP35 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm28919A0A087WP35 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm28919A0A087WP35 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm28919A0A087WP35 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm28919A0A087WP35 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm28919A0A087WP35 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm28919A0A087WP35 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm28919A0A087WP35 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm28919A0A087WP35 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm28919A0A087WP35 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm28919A0A087WP35 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm28919A0A087WP35 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm28919A0A087WP35 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm28919A0A087WP35 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm28919A0A087WP35 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm28919A0A087WP35 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm28919A0A087WP35 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm28919A0A087WP35 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm28919A0A087WP35 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm28919A0A087WP35 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm28919A0A087WP35 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm28919A0A087WP35 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm28919A0A087WP35 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm28919A0A087WP35 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm28919A0A087WP35 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm28919A0A087WP35 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm28919A0A087WP35 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm28919A0A087WP35 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm28919A0A087WP35 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm28919A0A087WP35 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm28919A0A087WP35 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm28919A0A087WP35 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm28919A0A087WP35 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm28919A0A087WP35 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm28919A0A087WP35 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm28919A0A087WP35 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm28919A0A087WP35 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm28919A0A087WP35 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm28919A0A087WP35 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm28919A0A087WP35 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm28919A0A087WP35 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm28919A0A087WP35 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm28919A0A087WP35 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm28919A0A087WP35 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm28919A0A087WP35 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm28919A0A087WP35 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm28919A0A087WP35 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm28919A0A087WP35 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm28919A0A087WP35 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm28919A0A087WP35 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm28919A0A087WP35 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm28919A0A087WP35 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm28919A0A087WP35 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gm28919A0A087WP35 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gm28919A0A087WP35 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm28919A0A087WP35 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm28919A0A087WP35 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm28919A0A087WP35 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm28919A0A087WP35 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm28919A0A087WP35 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm28919A0A087WP35 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm28919A0A087WP35 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm28919A0A087WP35 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm28919A0A087WP35 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm28919A0A087WP35 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm28919A0A087WP35 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm28919A0A087WP35 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm28919A0A087WP35 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm28919A0A087WP35 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm28919A0A087WP35 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm28919A0A087WP35 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm28919A0A087WP35 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm28919A0A087WP35 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm28919A0A087WP35 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm28919A0A087WP35 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm28919A0A087WP35 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm28919A0A087WP35 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm28919A0A087WP35 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm28919A0A087WP35 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm28919A0A087WP35 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm28919A0A087WP35 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm28919A0A087WP35 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm28919A0A087WP35 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm28919A0A087WP35 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm28919A0A087WP35 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm28919A0A087WP35 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm28919A0A087WP35 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm28919A0A087WP35 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm28919A0A087WP35 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm28919A0A087WP35 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm28919A0A087WP35 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm28919A0A087WP35 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Gm28919A0A087WP35 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms