Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP28

Gm28510, Predicted gene 28510, mousemouse

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Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28510A0A087WP28 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm28510A0A087WP28 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm28510A0A087WP28 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm28510A0A087WP28 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm28510A0A087WP28 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm28510A0A087WP28 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm28510A0A087WP28 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm28510A0A087WP28 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm28510A0A087WP28 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm28510A0A087WP28 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm28510A0A087WP28 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm28510A0A087WP28 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm28510A0A087WP28 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm28510A0A087WP28 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm28510A0A087WP28 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm28510A0A087WP28 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm28510A0A087WP28 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm28510A0A087WP28 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm28510A0A087WP28 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm28510A0A087WP28 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm28510A0A087WP28 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm28510A0A087WP28 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm28510A0A087WP28 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm28510A0A087WP28 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm28510A0A087WP28 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm28510A0A087WP28 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm28510A0A087WP28 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm28510A0A087WP28 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm28510A0A087WP28 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm28510A0A087WP28 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm28510A0A087WP28 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm28510A0A087WP28 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm28510A0A087WP28 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm28510A0A087WP28 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm28510A0A087WP28 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm28510A0A087WP28 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm28510A0A087WP28 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm28510A0A087WP28 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm28510A0A087WP28 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm28510A0A087WP28 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm28510A0A087WP28 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm28510A0A087WP28 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm28510A0A087WP28 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm28510A0A087WP28 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm28510A0A087WP28 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm28510A0A087WP28 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm28510A0A087WP28 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm28510A0A087WP28 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm28510A0A087WP28 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm28510A0A087WP28 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm28510A0A087WP28 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm28510A0A087WP28 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm28510A0A087WP28 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm28510A0A087WP28 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm28510A0A087WP28 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm28510A0A087WP28 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm28510A0A087WP28 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm28510A0A087WP28 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm28510A0A087WP28 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm28510A0A087WP28 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm28510A0A087WP28 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm28510A0A087WP28 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm28510A0A087WP28 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm28510A0A087WP28 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm28510A0A087WP28 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm28510A0A087WP28 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm28510A0A087WP28 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm28510A0A087WP28 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm28510A0A087WP28 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm28510A0A087WP28 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm28510A0A087WP28 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm28510A0A087WP28 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm28510A0A087WP28 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
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