Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 MFAP3L-203ENST00000393704 5827 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 PTPN14-201ENST00000366956 12985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 CSDE1-204ENST00000369530 3774 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 GABRQ-201ENST00000598523 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 OR2A3P-202ENST00000641249 1776 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 ZC3H8-202ENST00000409573 5965 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 ALDH1A1-202ENST00000376939 822 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 MIR99A-201ENST00000384906 81 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 LDHAP5-201ENST00000394996 622 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AL627308.2-201ENST00000420014 432 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC010145.1-201ENST00000422415 516 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 BMP6P1-201ENST00000431230 679 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 OR5M13P-201ENST00000433944 937 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 SYNJ2-IT1-201ENST00000442328 599 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 RBMY3AP-201ENST00000449381 1145 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AL390026.1-201ENST00000456647 457 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AP003385.3-201ENST00000472498 287 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC005550.2-201ENST00000476382 318 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 GBA3-201ENST00000503442 1232 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 DCAF13P2-201ENST00000514188 555 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC027541.1-201ENST00000519306 485 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC016405.1-202ENST00000524348 758 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AP000435.1-201ENST00000528539 496 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC022509.1-203ENST00000541940 708 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 NDUFA3P4-201ENST00000560814 250 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC010287.1-201ENST00000566916 357 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC010761.3-201ENST00000578819 499 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 PRR13P5-201ENST00000596581 442 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC247036.1-201ENST00000605005 389 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 CCL15-204ENST00000617897 1073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 TRIM49D1-203ENST00000605881 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC020904.2-202ENST00000614660 1401 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 MYLK-206ENST00000418370 7282 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 FAM13A-AS1-202ENST00000511543 2453 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC005840.3-201ENST00000541888 1803 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 C15orf41-202ENST00000437989 2240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 SIAH3-201ENST00000400405 7057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 HBS1L-206ENST00000415177 2636 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 EGFLAM-AS4-201ENST00000512496 1579 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 UGT2B4-201ENST00000305107 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 GAN-202ENST00000568107 15244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 NASP-203ENST00000372052 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 HHIP-201ENST00000296575 10072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 BCO2-203ENST00000438022 2598 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 TBX5-202ENST00000349716 3585 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 TMC5-205ENST00000542583 4872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 SCG5-201ENST00000300175 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 IL6-202ENST00000401630 765 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 SUMO2P13-201ENST00000403109 272 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 ZBTB8OSP2-201ENST00000423890 504 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 SNRPEP5-201ENST00000425442 278 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AP003385.1-201ENST00000426387 893 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
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HOXD12P35452 AL445623.1-201ENST00000440888 237 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC093668.1-201ENST00000514917 911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 CLEC4E-206ENST00000545274 730 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 FOXG1-AS1-203ENST00000551395 602 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AL135978.1-201ENST00000553618 1266 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AL157871.4-201ENST00000557226 385 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 IGHV1OR15-3-201ENST00000564926 351 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 EEF1B2P1-201ENST00000567221 672 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC008752.2-201ENST00000591174 750 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 RPSAP66-201ENST00000592196 606 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AL390037.1-201ENST00000610918 431 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC087633.2-208ENST00000612877 502 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 PTP4A1-206ENST00000627002 447 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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