Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 MED21-201ENST00000282892 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 LINC01697-202ENST00000426534 1764 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 NCOA4-204ENST00000581486 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 ZNF521-214ENST00000584787 4327 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 ZBTB18-201ENST00000358704 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 REG1A-201ENST00000233735 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 ATP5J2-201ENST00000292475 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 IL22-201ENST00000328087 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 KRTAP19-6-201ENST00000334046 330 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 RNA5SP218-201ENST00000363188 109 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AL445193.2-201ENST00000419596 620 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AL593856.1-201ENST00000419949 805 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AL390840.1-201ENST00000420303 988 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AL354794.2-201ENST00000424795 1248 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AC104698.1-201ENST00000435671 276 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AC002486.2-201ENST00000447806 590 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AC009269.1-201ENST00000470368 833 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AC084878.1-201ENST00000480555 648 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 SSX8-201ENST00000506270 579 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 MYL6-211ENST00000548580 528 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AL162171.2-201ENST00000555444 905 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AC023813.3-201ENST00000561876 539 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AC007614.3-201ENST00000564875 654 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 LINC02180-201ENST00000566439 1010 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 MED31-202ENST00000574128 619 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 PPIAP14-201ENST00000577627 496 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 LINC00469-203ENST00000579749 583 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AP006587.6-201ENST00000582128 1091 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AC068254.1-201ENST00000584753 483 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 COX6CP16-201ENST00000603667 216 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AL359094.1-211ENST00000608350 335 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AC004448.4-210ENST00000610229 833 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 FRG2MP-201ENST00000613317 856 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AL121985.2-201ENST00000621192 555 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 SORBS2-221ENST00000437304 3381 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 NPHP1-201ENST00000316534 3756 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 NDRG3-203ENST00000373773 2098 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 TTLL4-210ENST00000442769 3971 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 CYP19A1-216ENST00000559878 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 RND3-201ENST00000263895 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 NUP43-201ENST00000340413 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 CIR1-201ENST00000342016 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 ATXN2-214ENST00000535949 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AC007993.1-201ENST00000621298 2430 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AL355488.1-201ENST00000449169 2611 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 GNG13-201ENST00000248150 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 HNRNPCL4-201ENST00000323770 882 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 TOMM7-202ENST00000372879 514 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 FAM107B-203ENST00000378462 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 TRAV12-1-201ENST00000390433 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 CNPY1-202ENST00000406197 560 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 SNORA3.1-201ENST00000408166 111 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 RNA5SP231-201ENST00000410496 138 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AL161725.1-203ENST00000415004 1081 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 FTOP1-201ENST00000419363 861 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AC073900.1-201ENST00000429766 776 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 NIP7P1-201ENST00000433227 512 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 IGKV6D-21-201ENST00000436451 409 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AL353803.3-201ENST00000444641 335 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AC026336.1-201ENST00000466577 351 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AC104126.1-201ENST00000504004 711 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AC116049.2-201ENST00000508572 754 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AC025176.1-201ENST00000510261 365 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 XAGE1B-205ENST00000518075 472 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AL161747.2-201ENST00000535893 472 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AL023284.3-202ENST00000571188 543 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 EIF1-207ENST00000591776 797 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AC011468.2-202ENST00000594362 579 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AL035417.2-201ENST00000603887 796 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AC023206.1-201ENST00000605824 298 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AL121583.1-201ENST00000612444 682 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 FKBP1AP4-201ENST00000631775 336 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AC002115.2-201ENST00000640449 603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 CRBN-201ENST00000231948 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 AC019270.1-201ENST00000523495 3488 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FANCFQ9NPI8 LRRC31-202ENST00000316428 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116 ms