Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 TAT-201ENST00000355962 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 ZC3H11B-201ENST00000367211 2994 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 POF1B-202ENST00000373145 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 GDNF-202ENST00000344622 3655 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 ZSCAN5A-201ENST00000391713 3562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 OVAAL-201ENST00000442621 1489 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 LINC00652-201ENST00000412553 3299 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 HEPACAM2-201ENST00000341723 2122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 RN7SKP107-201ENST00000364157 290 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 RPL12P1-201ENST00000374520 498 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 NOX4-203ENST00000375979 816 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AL031005.1-201ENST00000416959 723 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 CHL1-AS1-201ENST00000417612 913 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 TAS2R2P-201ENST00000421146 910 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC093107.1-201ENST00000422772 609 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC073188.3-201ENST00000425228 339 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AL357632.1-201ENST00000426688 643 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AF274573.1-201ENST00000430535 494 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 PHB2P1-201ENST00000434943 890 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 HCG20-208ENST00000439406 1202 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC009237.4-201ENST00000441078 238 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 SLC8A1-AS1-207ENST00000444629 935 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 SNORA81.1-201ENST00000458922 177 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 RN7SL282P-201ENST00000479676 297 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC055758.2-201ENST00000495382 799 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 RPL5P11-201ENST00000498068 893 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC027315.1-201ENST00000511592 469 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC244502.1-205ENST00000535351 571 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC103968.1-201ENST00000557841 573 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC108449.2-201ENST00000560865 552 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AL034376.2-201ENST00000568110 573 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC006441.4-202ENST00000577621 510 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 LINC01892-201ENST00000579141 507 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 SMIM11B-203ENST00000622934 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 OR5AU1-204ENST00000641822 1197 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 ODF2L-201ENST00000294678 4267 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 INTS12-202ENST00000394735 1927 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 TMCO5A-205ENST00000559502 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 FDFT1-222ENST00000538689 2289 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 ZNF790-206ENST00000613249 2183 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AL355306.2-201ENST00000635570 1542 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 KLHL5-203ENST00000381930 3288 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 SAMD3-204ENST00000439090 2093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 CYP2C8-212ENST00000623108 1962 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 EGFEM1P-205ENST00000483846 2327 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 LINC01772-201ENST00000457898 3245 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC097634.1-201ENST00000604491 2467 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 MAPK10-207ENST00000395166 3085 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 TBC1D19-205ENST00000511789 1386 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 EEF1A1P20-201ENST00000514852 1386 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 ERVW-1-202ENST00000603053 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 TAS2R7-201ENST00000240687 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 ATP6V0E1-201ENST00000265093 773 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 ALOX5AP-201ENST00000380490 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 MIR152-201ENST00000385212 87 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 HCG25-217ENST00000422366 702 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 CBWD5-209ENST00000430059 1242 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 LINC00160-201ENST00000430635 693 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 NPPA-AS1-202ENST00000446542 1032 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 BX323845.2-201ENST00000458382 234 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC135721.2-201ENST00000464237 300 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 PABPC1P10-201ENST00000464731 381 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 TAAR3P-201ENST00000466706 1078 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 TAAR3P-202ENST00000481759 1025 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 RN7SL306P-201ENST00000492941 296 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 CYB5A-204ENST00000494131 776 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 RN7SL182P-201ENST00000496499 300 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 HNRNPA1P17-201ENST00000496620 924 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC122710.2-201ENST00000506093 596 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC106798.1-202ENST00000506819 589 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 RPS23-208ENST00000512493 443 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC234917.1-201ENST00000534006 316 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC079866.1-201ENST00000534985 1220 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC233290.1-201ENST00000553021 1186 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC016526.1-201ENST00000555465 520 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 LINC02284-201ENST00000558120 573 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 MIR3187-201ENST00000583431 70 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC015802.4-202ENST00000591967 474 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC019080.4-201ENST00000606200 564 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms