Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 ZNF90-201ENST00000418063 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 COL21A1-203ENST00000370819 4094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 MYO6-208ENST00000627432 4074 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 ACOD1-201ENST00000377462 2165 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AL161891.1-201ENST00000621575 4636 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 FARP1-219ENST00000596580 13532 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 TNFRSF19-204ENST00000403372 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC096745.2-201ENST00000627783 1914 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 ATP2B4-204ENST00000367218 8918 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC007278.1-201ENST00000450893 1327 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 BDNF-AS-201ENST00000499008 2324 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 GNG13-201ENST00000248150 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 SPAG11B-201ENST00000297498 795 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 RNA5SP114-201ENST00000363780 113 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 SPRR2D-202ENST00000368756 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 NXT2-204ENST00000372107 937 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 RN7SKP207-201ENST00000411204 303 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AL390856.1-201ENST00000412174 628 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC092042.2-201ENST00000417304 331 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AL109924.2-201ENST00000419800 934 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 YWHAZP5-201ENST00000419975 730 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 OR7E117P-201ENST00000422682 1112 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC073900.1-201ENST00000429766 776 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AL845321.1-201ENST00000444603 348 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 SS18L2P1-201ENST00000445923 213 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 VN1R6P-201ENST00000458417 907 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC126615.1-201ENST00000470084 630 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 OR9A1P-202ENST00000484361 945 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC104123.1-203ENST00000513158 575 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC108097.1-201ENST00000568275 534 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 NQO2-209ENST00000606474 470 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AP002345.2-201ENST00000609961 904 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC022021.1-201ENST00000634334 843 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 BX664727.3-202ENST00000421686 1761 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 SIRPG-AS1-202ENST00000456177 2795 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 SPATA31C2-201ENST00000324915 3777 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 SAMMSON-203ENST00000641005 2168 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 RNASE13-201ENST00000382951 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC093829.1-201ENST00000506662 1618 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 BUB3-203ENST00000368865 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 ITPR1-204ENST00000443694 9513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 MFSD6-201ENST00000281416 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC079248.1-201ENST00000427568 1546 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 PIGN-221ENST00000638183 4046 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 CDY1-201ENST00000306609 2321 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 CDY1B-201ENST00000306882 2321 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 SH3D19-203ENST00000409598 5284 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 PHF11-201ENST00000357596 1471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 TAF1-203ENST00000373790 7629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC053481.2-201ENST00000602493 1815 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 ZEB2-205ENST00000419938 1755 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 RBM23-203ENST00000359890 10040 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 LMO7-205ENST00000377534 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 ROBO1-202ENST00000464233 6742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 LOXHD1-201ENST00000300591 3970 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 GPCPD1-201ENST00000379019 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 FAM205C-201ENST00000340783 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 KLRG1-202ENST00000356986 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AL591503.1-201ENST00000366224 477 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 FCAR-205ENST00000391723 754 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 FAUP2-201ENST00000394301 401 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 C1D-203ENST00000409302 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC005162.1-201ENST00000416513 389 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC105275.1-201ENST00000417794 491 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC093580.1-201ENST00000420549 671 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 LINC01715-201ENST00000420776 624 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 LINC01980-202ENST00000425195 491 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC134879.1-201ENST00000426062 394 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 LINC01728-201ENST00000428529 524 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 RN7SL392P-201ENST00000473024 299 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC010168.1-201ENST00000501178 657 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 RPL32P3-203ENST00000506593 498 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 EGFLAM-211ENST00000514476 676 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC156455.1-201ENST00000538790 851 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC089984.3-201ENST00000552838 363 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC090607.2-201ENST00000560331 695 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
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