Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 MTND6P20-201ENST00000522986 418 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 AC115676.1-201ENST00000538416 329 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 AC003002.1-201ENST00000543226 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 PRB1-203ENST00000545626 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 AC048344.2-201ENST00000547280 147 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 CRADD-210ENST00000552033 622 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 RN7SL198P-201ENST00000583190 258 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 AC015801.1-201ENST00000585651 153 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 U47924.1-201ENST00000606539 434 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 AC097381.3-201ENST00000608962 462 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 GLYATL1-219ENST00000612196 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 Metazoa_SRP.180-201ENST00000612546 322 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 Metazoa_SRP.165-201ENST00000615681 260 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 SNORA43.5-201ENST00000631270 138 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 KRTAP9-1-202ENST00000634235 351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 Z96074.1-203ENST00000637685 1746 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 CLCN5-201ENST00000307367 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 IL5RA-201ENST00000256452 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 OVAAL-201ENST00000442621 1489 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 CAP2-203ENST00000465994 1404 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 AP000866.1-202ENST00000529392 2792 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 IFNA7-201ENST00000239347 737 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 ANKS1B-201ENST00000329257 996 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 SMCP-201ENST00000368765 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 AL137058.2-203ENST00000398039 825 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 AL590286.1-201ENST00000404178 291 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 MS4A6A-201ENST00000412309 1284 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 VNN3-205ENST00000417437 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 ACTBP12-201ENST00000435871 418 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 AL359502.1-201ENST00000437334 692 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 LINC00350-201ENST00000438640 422 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 AC104162.1-204ENST00000443346 708 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 MIR4435-2HG-211ENST00000443467 826 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 AL596188.1-201ENST00000452888 370 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 RN7SL337P-201ENST00000462468 301 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 RN7SL36P-201ENST00000469345 276 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 RN7SL233P-201ENST00000469988 277 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 AC074386.1-206ENST00000487102 761 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 AC063943.2-201ENST00000495697 534 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 HSD3BP4-201ENST00000511509 1120 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 ZNF345-205ENST00000526123 458 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 OR9L1P-201ENST00000529493 933 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 AP003532.1-201ENST00000529936 310 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 AC009869.1-201ENST00000530418 528 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 AC126177.6-201ENST00000550420 1009 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 PFDN5-211ENST00000550846 392 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 LINC02301-202ENST00000555150 428 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 AC067796.1-201ENST00000586795 496 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 AC093074.1-201ENST00000590280 556 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 AC008622.1-201ENST00000597106 284 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 MIR7847-201ENST00000610912 103 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 Metazoa_SRP.155-201ENST00000616367 282 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 AC022743.1-201ENST00000624990 664 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 STK32A-209ENST00000626951 798 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 LINC01232-205ENST00000630421 1002 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 FAM240B-202ENST00000637691 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 TNNT3-218ENST00000641787 924 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 MFAP3L-202ENST00000393702 1505 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 AC022075.1-201ENST00000500682 2830 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 DHRS9-202ENST00000412271 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 ZNF559-212ENST00000592896 1488 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 TMEM135-201ENST00000305494 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 IARS-205ENST00000443024 4341 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 NIPA2P4-201ENST00000523928 1341 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HMGB1P1B2RPK0 NUP43-201ENST00000340413 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms