Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms