Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MED23Q9ULK4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms