Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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SH3BP4Q9P0V3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
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