Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms