Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms