Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRHQ9HD43 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRHQ9HD43 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRHQ9HD43 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRHQ9HD43 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRHQ9HD43 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRHQ9HD43 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRHQ9HD43 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRHQ9HD43 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRHQ9HD43 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRHQ9HD43 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRHQ9HD43 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRHQ9HD43 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRHQ9HD43 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms