Protein–RNA interactions for Protein: Q99K41

Emilin1, EMILIN-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emilin1Q99K41 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Emilin1Q99K41 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Emilin1Q99K41 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Emilin1Q99K41 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Emilin1Q99K41 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Emilin1Q99K41 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Emilin1Q99K41 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Emilin1Q99K41 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Emilin1Q99K41 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Emilin1Q99K41 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Emilin1Q99K41 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Emilin1Q99K41 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Emilin1Q99K41 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Emilin1Q99K41 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Emilin1Q99K41 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Emilin1Q99K41 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Emilin1Q99K41 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Emilin1Q99K41 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Emilin1Q99K41 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Emilin1Q99K41 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms