Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms