Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms