Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2Q0

YDL007C-A, Putative uncharacterized protein YDL007C-A, yeastyeast

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YDL007C-AQ2V2Q0 PRP42YDR235W 1635 nt0.71□□□□□ -2.3
YDL007C-AQ2V2Q0 YLR041WYLR041W 321 nt0.7□□□□□ -2.3
YDL007C-AQ2V2Q0 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt0.7□□□□□ -2.3
YDL007C-AQ2V2Q0 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.69□□□□□ -2.3
YDL007C-AQ2V2Q0 YOR302WYOR302W 78 nt0.69□□□□□ -2.3
YDL007C-AQ2V2Q0 APQ12YIL040W 417 nt0.68□□□□□ -2.3
YDL007C-AQ2V2Q0 PAM16YJL104W 450 nt0.67□□□□□ -2.3
YDL007C-AQ2V2Q0 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.66□□□□□ -2.3
YDL007C-AQ2V2Q0 LTE1YAL024C 4308 nt0.65□□□□□ -2.31
YDL007C-AQ2V2Q0 UTP8YGR128C 2142 nt0.64□□□□□ -2.31
YDL007C-AQ2V2Q0 DOP1YDR141C 5097 nt0.64□□□□□ -2.31
YDL007C-AQ2V2Q0 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.64□□□□□ -2.31
YDL007C-AQ2V2Q0 YSP1YHR155W 3687 nt0.62□□□□□ -2.31
YDL007C-AQ2V2Q0 TRS65YGR166W 1683 nt0.62□□□□□ -2.31
YDL007C-AQ2V2Q0 SNU13YEL026W 381 nt0.61□□□□□ -2.31
YDL007C-AQ2V2Q0 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt0.61□□□□□ -2.31
YDL007C-AQ2V2Q0 PET111YMR257C 2403 nt0.61□□□□□ -2.31
YDL007C-AQ2V2Q0 BEM3YPL115C 3387 nt0.61□□□□□ -2.31
YDL007C-AQ2V2Q0 UTP10YJL109C 5310 nt0.59□□□□□ -2.31
YDL007C-AQ2V2Q0 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.59□□□□□ -2.31
YDL007C-AQ2V2Q0 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.59□□□□□ -2.31
YDL007C-AQ2V2Q0 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.59□□□□□ -2.31
YDL007C-AQ2V2Q0 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.59□□□□□ -2.31
YDL007C-AQ2V2Q0 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.59□□□□□ -2.31
YDL007C-AQ2V2Q0 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.59□□□□□ -2.31
YDL007C-AQ2V2Q0 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.59□□□□□ -2.31
YDL007C-AQ2V2Q0 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.59□□□□□ -2.31
YDL007C-AQ2V2Q0 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.59□□□□□ -2.31
YDL007C-AQ2V2Q0 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.59□□□□□ -2.31
YDL007C-AQ2V2Q0 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.59□□□□□ -2.31
YDL007C-AQ2V2Q0 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.59□□□□□ -2.32
YDL007C-AQ2V2Q0 NNF2YGR089W 2811 nt0.58□□□□□ -2.32
YDL007C-AQ2V2Q0 YLR232WYLR232W 348 nt0.57□□□□□ -2.32
YDL007C-AQ2V2Q0 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.57□□□□□ -2.32
YDL007C-AQ2V2Q0 PAU12YGR294W 363 nt0.56□□□□□ -2.32
YDL007C-AQ2V2Q0 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.56□□□□□ -2.32
YDL007C-AQ2V2Q0 PRP39YML046W 1890 nt0.54□□□□□ -2.32
YDL007C-AQ2V2Q0 TAH1YCR060W 336 nt0.53□□□□□ -2.32
YDL007C-AQ2V2Q0 YEL014CYEL014C 306 nt0.53□□□□□ -2.32
YDL007C-AQ2V2Q0 YJL182CYJL182C 318 nt0.53□□□□□ -2.32
YDL007C-AQ2V2Q0 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.52□□□□□ -2.33
YDL007C-AQ2V2Q0 SBH1YER087C-B 249 nt0.51□□□□□ -2.33
YDL007C-AQ2V2Q0 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt0.51□□□□□ -2.33
YDL007C-AQ2V2Q0 MLP1YKR095W 5628 nt0.51□□□□□ -2.33
YDL007C-AQ2V2Q0 MYO1YHR023W 5787 nt0.5□□□□□ -2.33
YDL007C-AQ2V2Q0 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.49□□□□□ -2.33
YDL007C-AQ2V2Q0 RPS26AYGL189C 360 nt0.49□□□□□ -2.33
YDL007C-AQ2V2Q0 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt0.49□□□□□ -2.33
YDL007C-AQ2V2Q0 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.49□□□□□ -2.33
YDL007C-AQ2V2Q0 NIP1YMR309C 2439 nt0.48□□□□□ -2.33
YDL007C-AQ2V2Q0 SPG3YDR504C 384 nt0.48□□□□□ -2.33
YDL007C-AQ2V2Q0 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt0.46□□□□□ -2.34
YDL007C-AQ2V2Q0 YDR544CYDR544C 429 nt0.46□□□□□ -2.34
YDL007C-AQ2V2Q0 YGL182CYGL182C 324 nt0.46□□□□□ -2.34
YDL007C-AQ2V2Q0 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt0.46□□□□□ -2.34
YDL007C-AQ2V2Q0 snR46snR46 197 nt0.46□□□□□ -2.34
YDL007C-AQ2V2Q0 snR52snR52 92 nt0.46□□□□□ -2.34
YDL007C-AQ2V2Q0 ORC3YLL004W 1851 nt0.44□□□□□ -2.34
YDL007C-AQ2V2Q0 JLP2YMR132C 627 nt0.44□□□□□ -2.34
YDL007C-AQ2V2Q0 ULP2YIL031W 3105 nt0.44□□□□□ -2.34
YDL007C-AQ2V2Q0 BUL2YML111W 2763 nt0.43□□□□□ -2.34
YDL007C-AQ2V2Q0 YEL073CYEL073C 324 nt0.43□□□□□ -2.34
YDL007C-AQ2V2Q0 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt0.43□□□□□ -2.34
YDL007C-AQ2V2Q0 GLG1YKR058W 1851 nt0.43□□□□□ -2.34
YDL007C-AQ2V2Q0 SDH6YDR379C-A 240 nt0.42□□□□□ -2.34
YDL007C-AQ2V2Q0 YMR160WYMR160W 2451 nt0.42□□□□□ -2.34
YDL007C-AQ2V2Q0 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt0.4□□□□□ -2.35
YDL007C-AQ2V2Q0 COG6YNL041C 2520 nt0.39□□□□□ -2.35
YDL007C-AQ2V2Q0 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt0.39□□□□□ -2.35
YDL007C-AQ2V2Q0 STF2YGR008C 255 nt0.36□□□□□ -2.35
YDL007C-AQ2V2Q0 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt0.36□□□□□ -2.35
YDL007C-AQ2V2Q0 CSE1YGL238W 2883 nt0.36□□□□□ -2.35
YDL007C-AQ2V2Q0 BIR1YJR089W 2865 nt0.36□□□□□ -2.35
YDL007C-AQ2V2Q0 YOR170WYOR170W 306 nt0.35□□□□□ -2.35
YDL007C-AQ2V2Q0 RCO1YMR075W 2055 nt0.34□□□□□ -2.36
YDL007C-AQ2V2Q0 IQG1YPL242C 4488 nt0.32□□□□□ -2.36
YDL007C-AQ2V2Q0 RPM2YML091C 3609 nt0.31□□□□□ -2.36
YDL007C-AQ2V2Q0 HUG1YML058W-A 207 nt0.31□□□□□ -2.36
YDL007C-AQ2V2Q0 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.3□□□□□ -2.36
YDL007C-AQ2V2Q0 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.29□□□□□ -2.36
YDL007C-AQ2V2Q0 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.29□□□□□ -2.36
YDL007C-AQ2V2Q0 FMP27YLR454W 7887 nt0.28□□□□□ -2.36
YDL007C-AQ2V2Q0 MLP2YIL149C 5040 nt0.28□□□□□ -2.36
YDL007C-AQ2V2Q0 YJL150WYJL150W 303 nt0.28□□□□□ -2.36
YDL007C-AQ2V2Q0 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt0.27□□□□□ -2.37
YDL007C-AQ2V2Q0 YDR210WYDR210W 228 nt0.26□□□□□ -2.37
YDL007C-AQ2V2Q0 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.24□□□□□ -2.37
YDL007C-AQ2V2Q0 snR48snR48 113 nt0.24□□□□□ -2.37
YDL007C-AQ2V2Q0 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt0.23□□□□□ -2.37
YDL007C-AQ2V2Q0 YBR099CYBR099C 384 nt0.23□□□□□ -2.37
YDL007C-AQ2V2Q0 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.21□□□□□ -2.38
YDL007C-AQ2V2Q0 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.21□□□□□ -2.38
YDL007C-AQ2V2Q0 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.21□□□□□ -2.38
YDL007C-AQ2V2Q0 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.21□□□□□ -2.38
YDL007C-AQ2V2Q0 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.21□□□□□ -2.38
YDL007C-AQ2V2Q0 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.21□□□□□ -2.38
YDL007C-AQ2V2Q0 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.21□□□□□ -2.38
YDL007C-AQ2V2Q0 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.21□□□□□ -2.38
YDL007C-AQ2V2Q0 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt0.2□□□□□ -2.38
YDL007C-AQ2V2Q0 snR39BsnR39B 96 nt0.19□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.6 ms