Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

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Length 614 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCOA4Q13772 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCOA4Q13772 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCOA4Q13772 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCOA4Q13772 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCOA4Q13772 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCOA4Q13772 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCOA4Q13772 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCOA4Q13772 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCOA4Q13772 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCOA4Q13772 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCOA4Q13772 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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