Protein–RNA interactions for Protein: Q12493

NKP1, Inner kinetochore subunit NKP1, yeastyeast

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NKP1Q12493 PRP16YKR086W 3216 nt0.91□□□□□ -2.26
NKP1Q12493 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.91□□□□□ -2.26
NKP1Q12493 YJL150WYJL150W 303 nt0.91□□□□□ -2.26
NKP1Q12493 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.91□□□□□ -2.26
NKP1Q12493 SEC1YDR164C 2175 nt0.9□□□□□ -2.26
NKP1Q12493 YNL198CYNL198C 303 nt0.9□□□□□ -2.27
NKP1Q12493 SEC8YPR055W 3198 nt0.9□□□□□ -2.27
NKP1Q12493 SIP4YJL089W 2490 nt0.89□□□□□ -2.27
NKP1Q12493 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.89□□□□□ -2.27
NKP1Q12493 PRP42YDR235W 1635 nt0.88□□□□□ -2.27
NKP1Q12493 CHS6YJL099W 2241 nt0.88□□□□□ -2.27
NKP1Q12493 PRP5YBR237W 2550 nt0.87□□□□□ -2.27
NKP1Q12493 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt0.86□□□□□ -2.27
NKP1Q12493 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt0.86□□□□□ -2.27
NKP1Q12493 YLR041WYLR041W 321 nt0.86□□□□□ -2.27
NKP1Q12493 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.86□□□□□ -2.27
NKP1Q12493 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.86□□□□□ -2.27
NKP1Q12493 PAU24YBR301W 363 nt0.86□□□□□ -2.27
NKP1Q12493 UTP8YGR128C 2142 nt0.86□□□□□ -2.27
NKP1Q12493 PRP39YML046W 1890 nt0.86□□□□□ -2.27
NKP1Q12493 IML1YJR138W 4755 nt0.84□□□□□ -2.28
NKP1Q12493 LTE1YAL024C 4308 nt0.83□□□□□ -2.28
NKP1Q12493 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt0.83□□□□□ -2.28
NKP1Q12493 YNL337WYNL337W 255 nt0.82□□□□□ -2.28
NKP1Q12493 YEL073CYEL073C 324 nt0.81□□□□□ -2.28
NKP1Q12493 TRS65YGR166W 1683 nt0.81□□□□□ -2.28
NKP1Q12493 TAH1YCR060W 336 nt0.8□□□□□ -2.28
NKP1Q12493 OST4YDL232W 111 nt0.8□□□□□ -2.28
NKP1Q12493 YDR544CYDR544C 429 nt0.79□□□□□ -2.28
NKP1Q12493 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.79□□□□□ -2.28
NKP1Q12493 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt0.79□□□□□ -2.28
NKP1Q12493 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.78□□□□□ -2.28
NKP1Q12493 SNU13YEL026W 381 nt0.78□□□□□ -2.28
NKP1Q12493 YGR151CYGR151C 336 nt0.78□□□□□ -2.28
NKP1Q12493 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt0.78□□□□□ -2.28
NKP1Q12493 YGL182CYGL182C 324 nt0.77□□□□□ -2.29
NKP1Q12493 UBP3YER151C 2739 nt0.77□□□□□ -2.29
NKP1Q12493 YLR232WYLR232W 348 nt0.76□□□□□ -2.29
NKP1Q12493 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.75□□□□□ -2.29
NKP1Q12493 BEM3YPL115C 3387 nt0.73□□□□□ -2.29
NKP1Q12493 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt0.73□□□□□ -2.29
NKP1Q12493 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.72□□□□□ -2.29
NKP1Q12493 YNL338WYNL338W 159 nt0.71□□□□□ -2.3
NKP1Q12493 YBL053WYBL053W 375 nt0.69□□□□□ -2.3
NKP1Q12493 UTP10YJL109C 5310 nt0.68□□□□□ -2.3
NKP1Q12493 YSP1YHR155W 3687 nt0.68□□□□□ -2.3
NKP1Q12493 NNF2YGR089W 2811 nt0.67□□□□□ -2.3
NKP1Q12493 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.67□□□□□ -2.3
NKP1Q12493 ANS1YHR126C 480 nt0.66□□□□□ -2.3
NKP1Q12493 YOR170WYOR170W 306 nt0.66□□□□□ -2.3
NKP1Q12493 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt0.65□□□□□ -2.31
NKP1Q12493 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt0.65□□□□□ -2.31
NKP1Q12493 PET111YMR257C 2403 nt0.65□□□□□ -2.31
NKP1Q12493 SDH6YDR379C-A 240 nt0.64□□□□□ -2.31
NKP1Q12493 PAU12YGR294W 363 nt0.64□□□□□ -2.31
NKP1Q12493 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.64□□□□□ -2.31
NKP1Q12493 COG6YNL041C 2520 nt0.64□□□□□ -2.31
NKP1Q12493 Q0032Q0032 291 nt0.62□□□□□ -2.31
NKP1Q12493 YOR225WYOR225W 330 nt0.62□□□□□ -2.31
NKP1Q12493 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt0.62□□□□□ -2.31
NKP1Q12493 MLP1YKR095W 5628 nt0.61□□□□□ -2.31
NKP1Q12493 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt0.61□□□□□ -2.31
NKP1Q12493 YOR102WYOR102W 351 nt0.6□□□□□ -2.31
NKP1Q12493 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.59□□□□□ -2.31
NKP1Q12493 RPS26AYGL189C 360 nt0.59□□□□□ -2.31
NKP1Q12493 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt0.59□□□□□ -2.31
NKP1Q12493 snR48snR48 113 nt0.59□□□□□ -2.31
NKP1Q12493 ORC3YLL004W 1851 nt0.58□□□□□ -2.32
NKP1Q12493 SBH1YER087C-B 249 nt0.58□□□□□ -2.32
NKP1Q12493 snR39BsnR39B 96 nt0.58□□□□□ -2.32
NKP1Q12493 NIP1YMR309C 2439 nt0.58□□□□□ -2.32
NKP1Q12493 YDR210WYDR210W 228 nt0.57□□□□□ -2.32
NKP1Q12493 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt0.57□□□□□ -2.32
NKP1Q12493 QCR9YGR183C 201 nt0.56□□□□□ -2.32
NKP1Q12493 GLG1YKR058W 1851 nt0.55□□□□□ -2.32
NKP1Q12493 BUL2YML111W 2763 nt0.55□□□□□ -2.32
NKP1Q12493 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.54□□□□□ -2.32
NKP1Q12493 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.54□□□□□ -2.32
NKP1Q12493 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.54□□□□□ -2.32
NKP1Q12493 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.54□□□□□ -2.32
NKP1Q12493 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.54□□□□□ -2.32
NKP1Q12493 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.54□□□□□ -2.32
NKP1Q12493 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.54□□□□□ -2.32
NKP1Q12493 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.54□□□□□ -2.32
NKP1Q12493 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.54□□□□□ -2.32
NKP1Q12493 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.54□□□□□ -2.32
NKP1Q12493 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.54□□□□□ -2.32
NKP1Q12493 CSE1YGL238W 2883 nt0.53□□□□□ -2.32
NKP1Q12493 YLR294CYLR294C 330 nt0.52□□□□□ -2.33
NKP1Q12493 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt0.51□□□□□ -2.33
NKP1Q12493 ULP2YIL031W 3105 nt0.51□□□□□ -2.33
NKP1Q12493 IQG1YPL242C 4488 nt0.48□□□□□ -2.33
NKP1Q12493 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.47□□□□□ -2.33
NKP1Q12493 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt0.47□□□□□ -2.33
NKP1Q12493 HUG1YML058W-A 207 nt0.44□□□□□ -2.34
NKP1Q12493 MLP2YIL149C 5040 nt0.43□□□□□ -2.34
NKP1Q12493 RCO1YMR075W 2055 nt0.42□□□□□ -2.34
NKP1Q12493 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt0.39□□□□□ -2.35
NKP1Q12493 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.39□□□□□ -2.35
NKP1Q12493 BIR1YJR089W 2865 nt0.38□□□□□ -2.35
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