Protein–RNA interactions for Protein: Q12490

TY1B-BL, Transposon Ty1-BL Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BLQ12490 YAR047CYAR047C 321 nt-1.23□□□□□ -2.61
TY1B-BLQ12490 PCC1YKR095W-A 267 nt-1.24□□□□□ -2.61
TY1B-BLQ12490 snR49snR49 165 nt-1.24□□□□□ -2.61
TY1B-BLQ12490 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt-1.25□□□□□ -2.61
TY1B-BLQ12490 YIL032CYIL032C 357 nt-1.26□□□□□ -2.61
TY1B-BLQ12490 APQ12YIL040W 417 nt-1.26□□□□□ -2.61
TY1B-BLQ12490 VPS20YMR077C 666 nt-1.26□□□□□ -2.61
TY1B-BLQ12490 RPS27BYHR021C 249 nt-1.26□□□□□ -2.61
TY1B-BLQ12490 YGL052WYGL052W 306 nt-1.31□□□□□ -2.62
TY1B-BLQ12490 YGR069WYGR069W 336 nt-1.31□□□□□ -2.62
TY1B-BLQ12490 PRM3YPL192C 402 nt-1.31□□□□□ -2.62
TY1B-BLQ12490 YAL066WYAL066W 309 nt-1.32□□□□□ -2.62
TY1B-BLQ12490 YLR269CYLR269C 351 nt-1.32□□□□□ -2.62
TY1B-BLQ12490 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt-1.33□□□□□ -2.62
TY1B-BLQ12490 CSE2YNR010W 450 nt-1.33□□□□□ -2.62
TY1B-BLQ12490 GPI15YNL038W 690 nt-1.34□□□□□ -2.62
TY1B-BLQ12490 TOM22YNL131W 459 nt-1.34□□□□□ -2.62
TY1B-BLQ12490 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt-1.37□□□□□ -2.63
TY1B-BLQ12490 snR54snR54 86 nt-1.37□□□□□ -2.63
TY1B-BLQ12490 YHR125WYHR125W 306 nt-1.38□□□□□ -2.63
TY1B-BLQ12490 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt-1.39□□□□□ -2.63
TY1B-BLQ12490 snR189snR189 189 nt-1.39□□□□□ -2.63
TY1B-BLQ12490 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt-1.39□□□□□ -2.63
TY1B-BLQ12490 YBR285WYBR285W 435 nt-1.4□□□□□ -2.63
TY1B-BLQ12490 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-1.42□□□□□ -2.64
TY1B-BLQ12490 YOR170WYOR170W 306 nt-1.42□□□□□ -2.64
TY1B-BLQ12490 YER090C-AYER090C-A 90 nt-1.44□□□□□ -2.64
TY1B-BLQ12490 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt-1.44□□□□□ -2.64
TY1B-BLQ12490 YDR544CYDR544C 429 nt-1.44□□□□□ -2.64
TY1B-BLQ12490 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt-1.45□□□□□ -2.64
TY1B-BLQ12490 YAF9YNL107W 681 nt-1.45□□□□□ -2.64
TY1B-BLQ12490 YOR121CYOR121C 306 nt-1.45□□□□□ -2.64
TY1B-BLQ12490 YER006C-AYER006C-A 318 nt-1.46□□□□□ -2.64
TY1B-BLQ12490 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt-1.46□□□□□ -2.64
TY1B-BLQ12490 YGL149WYGL149W 306 nt-1.48□□□□□ -2.65
TY1B-BLQ12490 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.49□□□□□ -2.65
TY1B-BLQ12490 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt-1.49□□□□□ -2.65
TY1B-BLQ12490 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-1.49□□□□□ -2.65
TY1B-BLQ12490 EAF6YJR082C 342 nt-1.51□□□□□ -2.65
TY1B-BLQ12490 SKI7YOR076C 2244 nt-1.51□□□□□ -2.65
TY1B-BLQ12490 snR74snR74 88 nt-1.52□□□□□ -2.65
TY1B-BLQ12490 JLP2YMR132C 627 nt-1.54□□□□□ -2.66
TY1B-BLQ12490 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt-1.54□□□□□ -2.66
TY1B-BLQ12490 YNL266WYNL266W 420 nt-1.56□□□□□ -2.66
TY1B-BLQ12490 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt-1.56□□□□□ -2.66
TY1B-BLQ12490 BI2Q0110 1272 nt-1.57□□□□□ -2.66
TY1B-BLQ12490 CSN9YDR179C 489 nt-1.57□□□□□ -2.66
TY1B-BLQ12490 MPC1YGL080W 393 nt-1.59□□□□□ -2.66
TY1B-BLQ12490 HMRA1YCR097W 381 nt-1.61□□□□□ -2.67
TY1B-BLQ12490 YER137W-AYER137W-A 306 nt-1.61□□□□□ -2.67
TY1B-BLQ12490 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt-1.64□□□□□ -2.67
TY1B-BLQ12490 YDL158CYDL158C 309 nt-1.67□□□□□ -2.68
TY1B-BLQ12490 snR81snR81 201 nt-1.67□□□□□ -2.68
TY1B-BLQ12490 snR50snR50 90 nt-1.7□□□□□ -2.68
TY1B-BLQ12490 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.7□□□□□ -2.68
TY1B-BLQ12490 STE18YJR086W 333 nt-1.7□□□□□ -2.68
TY1B-BLQ12490 YML099W-AYML099W-A 330 nt-1.71□□□□□ -2.68
TY1B-BLQ12490 snR77snR77 88 nt-1.72□□□□□ -2.68
TY1B-BLQ12490 Q0255Q0255 1419 nt-1.72□□□□□ -2.69
TY1B-BLQ12490 snR69snR69 101 nt-1.72□□□□□ -2.69
TY1B-BLQ12490 PMP2YEL017C-A 132 nt-1.72□□□□□ -2.69
TY1B-BLQ12490 RDS3YPR094W 324 nt-1.72□□□□□ -2.69
TY1B-BLQ12490 YDR102CYDR102C 333 nt-1.73□□□□□ -2.69
TY1B-BLQ12490 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.73□□□□□ -2.69
TY1B-BLQ12490 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-1.75□□□□□ -2.69
TY1B-BLQ12490 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt-1.75□□□□□ -2.69
TY1B-BLQ12490 YLR434CYLR434C 384 nt-1.75□□□□□ -2.69
TY1B-BLQ12490 YDR048CYDR048C 315 nt-1.76□□□□□ -2.69
TY1B-BLQ12490 snR60snR60 104 nt-1.77□□□□□ -2.69
TY1B-BLQ12490 YNL028WYNL028W 318 nt-1.77□□□□□ -2.69
TY1B-BLQ12490 YNL205CYNL205C 423 nt-1.77□□□□□ -2.69
TY1B-BLQ12490 snR41snR41 95 nt-1.79□□□□□ -2.7
TY1B-BLQ12490 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt-1.8□□□□□ -2.7
TY1B-BLQ12490 snR67snR67 82 nt-1.8□□□□□ -2.7
TY1B-BLQ12490 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-1.8□□□□□ -2.7
TY1B-BLQ12490 YKL123WYKL123W 381 nt-1.8□□□□□ -2.7
TY1B-BLQ12490 YML054C-AYML054C-A 159 nt-1.8□□□□□ -2.7
TY1B-BLQ12490 YFL032WYFL032W 321 nt-1.81□□□□□ -2.7
TY1B-BLQ12490 YNL324WYNL324W 396 nt-1.82□□□□□ -2.7
TY1B-BLQ12490 YER097WYER097W 330 nt-1.82□□□□□ -2.7
TY1B-BLQ12490 YLR202CYLR202C 327 nt-1.84□□□□□ -2.7
TY1B-BLQ12490 YNL122CYNL122C 348 nt-1.85□□□□□ -2.7
TY1B-BLQ12490 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-1.86□□□□□ -2.71
TY1B-BLQ12490 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt-1.87□□□□□ -2.71
TY1B-BLQ12490 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-1.88□□□□□ -2.71
TY1B-BLQ12490 YFL019CYFL019C 354 nt-1.89□□□□□ -2.71
TY1B-BLQ12490 ATP6Q0085 780 nt-1.9□□□□□ -2.71
TY1B-BLQ12490 YDR543CYDR543C 300 nt-1.9□□□□□ -2.71
TY1B-BLQ12490 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt-1.9□□□□□ -2.71
TY1B-BLQ12490 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt-1.92□□□□□ -2.72
TY1B-BLQ12490 snR39BsnR39B 96 nt-1.93□□□□□ -2.72
TY1B-BLQ12490 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt-1.95□□□□□ -2.72
TY1B-BLQ12490 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt-1.95□□□□□ -2.72
TY1B-BLQ12490 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt-1.96□□□□□ -2.72
TY1B-BLQ12490 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt-1.97□□□□□ -2.72
TY1B-BLQ12490 Q0142Q0142 177 nt-1.98□□□□□ -2.73
TY1B-BLQ12490 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt-1.98□□□□□ -2.73
TY1B-BLQ12490 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt-1.98□□□□□ -2.73
TY1B-BLQ12490 BIL1YOR304C-A 231 nt-1.99□□□□□ -2.73
TY1B-BLQ12490 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-1.99□□□□□ -2.73
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