Protein–RNA interactions for Protein: Q12150

CSF1, Protein CSF1, yeastyeast

Predictions only

Length 2,958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSF1Q12150 YNL266WYNL266W 420 nt-2.28□□□□□ -2.78
CSF1Q12150 YER188C-AYER188C-A 300 nt-2.29□□□□□ -2.78
CSF1Q12150 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-2.29□□□□□ -2.78
CSF1Q12150 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt-2.29□□□□□ -2.78
CSF1Q12150 AIM29YKR074W 468 nt-2.31□□□□□ -2.78
CSF1Q12150 YDR366CYDR366C 399 nt-2.32□□□□□ -2.78
CSF1Q12150 YAR029WYAR029W 225 nt-2.32□□□□□ -2.78
CSF1Q12150 YER090C-AYER090C-A 90 nt-2.33□□□□□ -2.78
CSF1Q12150 CSE2YNR010W 450 nt-2.33□□□□□ -2.78
CSF1Q12150 YCR001WYCR001W 315 nt-2.33□□□□□ -2.78
CSF1Q12150 snR24snR24 89 nt-2.33□□□□□ -2.78
CSF1Q12150 YDR426CYDR426C 378 nt-2.34□□□□□ -2.78
CSF1Q12150 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt-2.34□□□□□ -2.78
CSF1Q12150 VPS63YLR261C 327 nt-2.35□□□□□ -2.79
CSF1Q12150 ZEO1YOL109W 342 nt-2.35□□□□□ -2.79
CSF1Q12150 YKL083WYKL083W 615 nt-2.36□□□□□ -2.79
CSF1Q12150 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-2.36□□□□□ -2.79
CSF1Q12150 YLR334CYLR334C 381 nt-2.37□□□□□ -2.79
CSF1Q12150 YLR456WYLR456W 615 nt-2.37□□□□□ -2.79
CSF1Q12150 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt-2.38□□□□□ -2.79
CSF1Q12150 YAF9YNL107W 681 nt-2.39□□□□□ -2.79
CSF1Q12150 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt-2.39□□□□□ -2.79
CSF1Q12150 YGL230CYGL230C 444 nt-2.4□□□□□ -2.79
CSF1Q12150 YJR087WYJR087W 351 nt-2.4□□□□□ -2.79
CSF1Q12150 HMLALPHA2YCL067C 633 nt-2.4□□□□□ -2.79
CSF1Q12150 MATALPHA2YCR039C 633 nt-2.4□□□□□ -2.79
CSF1Q12150 HMRA2YCR096C 360 nt-2.4□□□□□ -2.79
CSF1Q12150 YLR269CYLR269C 351 nt-2.41□□□□□ -2.8
CSF1Q12150 MPC1YGL080W 393 nt-2.43□□□□□ -2.8
CSF1Q12150 YNL303WYNL303W 348 nt-2.43□□□□□ -2.8
CSF1Q12150 YML054C-AYML054C-A 159 nt-2.44□□□□□ -2.8
CSF1Q12150 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt-2.44□□□□□ -2.8
CSF1Q12150 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt-2.44□□□□□ -2.8
CSF1Q12150 LSM4YER112W 564 nt-2.46□□□□□ -2.8
CSF1Q12150 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt-2.48□□□□□ -2.81
CSF1Q12150 BNS1YGR230W 414 nt-2.5□□□□□ -2.81
CSF1Q12150 YOL106WYOL106W 354 nt-2.5□□□□□ -2.81
CSF1Q12150 PRM3YPL192C 402 nt-2.5□□□□□ -2.81
CSF1Q12150 GPI15YNL038W 690 nt-2.51□□□□□ -2.81
CSF1Q12150 YER175W-AYER175W-A 165 nt-2.52□□□□□ -2.81
CSF1Q12150 snR50snR50 90 nt-2.52□□□□□ -2.81
CSF1Q12150 ILM1YJR118C 612 nt-2.54□□□□□ -2.82
CSF1Q12150 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt-2.55□□□□□ -2.82
CSF1Q12150 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt-2.57□□□□□ -2.82
CSF1Q12150 YNL171CYNL171C 369 nt-2.57□□□□□ -2.82
CSF1Q12150 snR59snR59 78 nt-2.58□□□□□ -2.82
CSF1Q12150 YOR364WYOR364W 369 nt-2.59□□□□□ -2.82
CSF1Q12150 POP6YGR030C 477 nt-2.59□□□□□ -2.82
CSF1Q12150 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt-2.59□□□□□ -2.82
CSF1Q12150 YER181CYER181C 324 nt-2.6□□□□□ -2.83
CSF1Q12150 YDR544CYDR544C 429 nt-2.6□□□□□ -2.83
CSF1Q12150 TOM22YNL131W 459 nt-2.61□□□□□ -2.83
CSF1Q12150 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt-2.61□□□□□ -2.83
CSF1Q12150 YDR220CYDR220C 294 nt-2.64□□□□□ -2.83
CSF1Q12150 YLR217WYLR217W 324 nt-2.68□□□□□ -2.84
CSF1Q12150 YDR102CYDR102C 333 nt-2.69□□□□□ -2.84
CSF1Q12150 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt-2.7□□□□□ -2.84
CSF1Q12150 snR67snR67 82 nt-2.7□□□□□ -2.84
CSF1Q12150 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt-2.7□□□□□ -2.84
CSF1Q12150 PCC1YKR095W-A 267 nt-2.72□□□□□ -2.85
CSF1Q12150 YML099W-AYML099W-A 330 nt-2.73□□□□□ -2.85
CSF1Q12150 YJL150WYJL150W 303 nt-2.76□□□□□ -2.85
CSF1Q12150 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt-2.77□□□□□ -2.85
CSF1Q12150 snR69snR69 101 nt-2.78□□□□□ -2.85
CSF1Q12150 snR73snR73 106 nt-2.79□□□□□ -2.86
CSF1Q12150 YGL149WYGL149W 306 nt-2.79□□□□□ -2.86
CSF1Q12150 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-2.81□□□□□ -2.86
CSF1Q12150 YPR197CYPR197C 564 nt-2.83□□□□□ -2.86
CSF1Q12150 snR87snR87 109 nt-2.83□□□□□ -2.86
CSF1Q12150 YPR039WYPR039W 336 nt-2.84□□□□□ -2.86
CSF1Q12150 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-2.86□□□□□ -2.87
CSF1Q12150 YDL011CYDL011C 324 nt-2.88□□□□□ -2.87
CSF1Q12150 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt-2.89□□□□□ -2.87
CSF1Q12150 snR6snR6 112 nt-2.91□□□□□ -2.87
CSF1Q12150 YER137W-AYER137W-A 306 nt-2.91□□□□□ -2.87
CSF1Q12150 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt-2.94□□□□□ -2.88
CSF1Q12150 BUD26YDR241W 288 nt-2.95□□□□□ -2.88
CSF1Q12150 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-2.95□□□□□ -2.88
CSF1Q12150 YDL158CYDL158C 309 nt-2.95□□□□□ -2.88
CSF1Q12150 snR57snR57 88 nt-2.96□□□□□ -2.88
CSF1Q12150 YER097WYER097W 330 nt-2.96□□□□□ -2.88
CSF1Q12150 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt-2.98□□□□□ -2.89
CSF1Q12150 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt-2.99□□□□□ -2.89
CSF1Q12150 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-2.99□□□□□ -2.89
CSF1Q12150 snR9snR9 187 nt-2.99□□□□□ -2.89
CSF1Q12150 snR80snR80 171 nt-3□□□□□ -2.89
CSF1Q12150 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-3.01□□□□□ -2.89
CSF1Q12150 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-3.02□□□□□ -2.89
CSF1Q12150 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-3.06□□□□□ -2.9
CSF1Q12150 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-3.07□□□□□ -2.9
CSF1Q12150 snR55snR55 98 nt-3.08□□□□□ -2.9
CSF1Q12150 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt-3.09□□□□□ -2.9
CSF1Q12150 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-3.11□□□□□ -2.91
CSF1Q12150 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt-3.12□□□□□ -2.91
CSF1Q12150 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-3.13□□□□□ -2.91
CSF1Q12150 HMRA1YCR097W 381 nt-3.14□□□□□ -2.91
CSF1Q12150 RPL41BYDL133C-A 78 nt-3.14□□□□□ -2.91
CSF1Q12150 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt-3.15□□□□□ -2.91
CSF1Q12150 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt-3.15□□□□□ -2.91
CSF1Q12150 YNL170WYNL170W 396 nt-3.16□□□□□ -2.92
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.7 ms