Protein–RNA interactions for Protein: Q12146

PSF3, DNA replication complex GINS protein PSF3, yeastyeast

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PSF3Q12146 SEC8YPR055W 3198 nt1.14□□□□□ -2.23
PSF3Q12146 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt1.14□□□□□ -2.23
PSF3Q12146 YDL073WYDL073W 2955 nt1.13□□□□□ -2.23
PSF3Q12146 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt1.13□□□□□ -2.23
PSF3Q12146 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt1.13□□□□□ -2.23
PSF3Q12146 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt1.13□□□□□ -2.23
PSF3Q12146 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt1.13□□□□□ -2.23
PSF3Q12146 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt1.13□□□□□ -2.23
PSF3Q12146 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt1.13□□□□□ -2.23
PSF3Q12146 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt1.13□□□□□ -2.23
PSF3Q12146 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt1.13□□□□□ -2.23
PSF3Q12146 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt1.13□□□□□ -2.23
PSF3Q12146 BUD3YCL014W 4911 nt1.13□□□□□ -2.23
PSF3Q12146 YEL073CYEL073C 324 nt1.12□□□□□ -2.23
PSF3Q12146 YLR041WYLR041W 321 nt1.12□□□□□ -2.23
PSF3Q12146 PRP39YML046W 1890 nt1.12□□□□□ -2.23
PSF3Q12146 PRP42YDR235W 1635 nt1.11□□□□□ -2.23
PSF3Q12146 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt1.11□□□□□ -2.23
PSF3Q12146 QCR9YGR183C 201 nt1.11□□□□□ -2.23
PSF3Q12146 FYV10YIL097W 1551 nt1.11□□□□□ -2.23
PSF3Q12146 NST1YNL091W 3723 nt1.11□□□□□ -2.23
PSF3Q12146 DOP1YDR141C 5097 nt1.1□□□□□ -2.23
PSF3Q12146 Q0032Q0032 291 nt1.09□□□□□ -2.23
PSF3Q12146 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.09□□□□□ -2.23
PSF3Q12146 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.08□□□□□ -2.24
PSF3Q12146 VAM6YDL077C 3150 nt1.07□□□□□ -2.24
PSF3Q12146 YOR225WYOR225W 330 nt1.07□□□□□ -2.24
PSF3Q12146 PRP5YBR237W 2550 nt1.07□□□□□ -2.24
PSF3Q12146 UTP8YGR128C 2142 nt1.07□□□□□ -2.24
PSF3Q12146 YGR151CYGR151C 336 nt1.05□□□□□ -2.24
PSF3Q12146 YMR160WYMR160W 2451 nt1.04□□□□□ -2.24
PSF3Q12146 SCC2YDR180W 4482 nt1.03□□□□□ -2.24
PSF3Q12146 RKR1YMR247C 4689 nt1.03□□□□□ -2.24
PSF3Q12146 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt1.02□□□□□ -2.25
PSF3Q12146 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt1.01□□□□□ -2.25
PSF3Q12146 TRS65YGR166W 1683 nt1□□□□□ -2.25
PSF3Q12146 TAH1YCR060W 336 nt1□□□□□ -2.25
PSF3Q12146 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.99□□□□□ -2.25
PSF3Q12146 BEM2YER155C 6504 nt0.99□□□□□ -2.25
PSF3Q12146 CHS6YJL099W 2241 nt0.99□□□□□ -2.25
PSF3Q12146 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt0.98□□□□□ -2.25
PSF3Q12146 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.97□□□□□ -2.25
PSF3Q12146 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.97□□□□□ -2.25
PSF3Q12146 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.97□□□□□ -2.25
PSF3Q12146 YGL182CYGL182C 324 nt0.97□□□□□ -2.25
PSF3Q12146 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.97□□□□□ -2.25
PSF3Q12146 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.97□□□□□ -2.25
PSF3Q12146 OST4YDL232W 111 nt0.96□□□□□ -2.26
PSF3Q12146 YLR232WYLR232W 348 nt0.96□□□□□ -2.26
PSF3Q12146 YNL338WYNL338W 159 nt0.96□□□□□ -2.26
PSF3Q12146 SNU13YEL026W 381 nt0.94□□□□□ -2.26
PSF3Q12146 YSP1YHR155W 3687 nt0.92□□□□□ -2.26
PSF3Q12146 YOL014WYOL014W 375 nt0.91□□□□□ -2.26
PSF3Q12146 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.89□□□□□ -2.27
PSF3Q12146 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.89□□□□□ -2.27
PSF3Q12146 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.89□□□□□ -2.27
PSF3Q12146 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.89□□□□□ -2.27
PSF3Q12146 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.89□□□□□ -2.27
PSF3Q12146 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.89□□□□□ -2.27
PSF3Q12146 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.89□□□□□ -2.27
PSF3Q12146 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.89□□□□□ -2.27
PSF3Q12146 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.89□□□□□ -2.27
PSF3Q12146 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.89□□□□□ -2.27
PSF3Q12146 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.89□□□□□ -2.27
PSF3Q12146 YOR170WYOR170W 306 nt0.89□□□□□ -2.27
PSF3Q12146 BIR1YJR089W 2865 nt0.88□□□□□ -2.27
PSF3Q12146 BEM3YPL115C 3387 nt0.88□□□□□ -2.27
PSF3Q12146 YLR294CYLR294C 330 nt0.88□□□□□ -2.27
PSF3Q12146 YJR029WYJR029W 5268 nt0.88□□□□□ -2.27
PSF3Q12146 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.88□□□□□ -2.27
PSF3Q12146 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.87□□□□□ -2.27
PSF3Q12146 snR48snR48 113 nt0.87□□□□□ -2.27
PSF3Q12146 SEC1YDR164C 2175 nt0.87□□□□□ -2.27
PSF3Q12146 YDR544CYDR544C 429 nt0.86□□□□□ -2.27
PSF3Q12146 YOR102WYOR102W 351 nt0.85□□□□□ -2.27
PSF3Q12146 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt0.83□□□□□ -2.28
PSF3Q12146 ULP2YIL031W 3105 nt0.82□□□□□ -2.28
PSF3Q12146 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.81□□□□□ -2.28
PSF3Q12146 YBL053WYBL053W 375 nt0.81□□□□□ -2.28
PSF3Q12146 RPM2YML091C 3609 nt0.81□□□□□ -2.28
PSF3Q12146 NNF2YGR089W 2811 nt0.8□□□□□ -2.28
PSF3Q12146 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt0.8□□□□□ -2.28
PSF3Q12146 LTE1YAL024C 4308 nt0.79□□□□□ -2.28
PSF3Q12146 COG6YNL041C 2520 nt0.79□□□□□ -2.28
PSF3Q12146 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.79□□□□□ -2.28
PSF3Q12146 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.79□□□□□ -2.28
PSF3Q12146 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.78□□□□□ -2.28
PSF3Q12146 SDH6YDR379C-A 240 nt0.78□□□□□ -2.28
PSF3Q12146 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt0.78□□□□□ -2.28
PSF3Q12146 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt0.77□□□□□ -2.29
PSF3Q12146 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt0.77□□□□□ -2.29
PSF3Q12146 PET111YMR257C 2403 nt0.75□□□□□ -2.29
PSF3Q12146 GLG1YKR058W 1851 nt0.75□□□□□ -2.29
PSF3Q12146 FMP27YLR454W 7887 nt0.74□□□□□ -2.29
PSF3Q12146 BUL2YML111W 2763 nt0.74□□□□□ -2.29
PSF3Q12146 AI1Q0050 2505 nt0.73□□□□□ -2.29
PSF3Q12146 NIP1YMR309C 2439 nt0.72□□□□□ -2.29
PSF3Q12146 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt0.72□□□□□ -2.29
PSF3Q12146 snR39BsnR39B 96 nt0.72□□□□□ -2.29
PSF3Q12146 YDR210WYDR210W 228 nt0.71□□□□□ -2.3
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