Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms