Protein–RNA interactions for Protein: Q08416

IRC23, Increased recombination centers protein 23, yeast

Predictions only

Length 157 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IRC23	Q08416	YDR048C	YDR048C	315 nt		-0.3	□□□□□ -2.46
IRC23	Q08416	YGR164W	YGR164W	336 nt		-0.3	□□□□□ -2.46
IRC23	Q08416	YER079W	YER079W	633 nt		-0.31	□□□□□ -2.46
IRC23	Q08416	tW(UCA)Q	tW(UCA)Q	74 nt		-0.31	□□□□□ -2.46
IRC23	Q08416	YMR001C-A	YMR001C-A	231 nt		-0.31	□□□□□ -2.46
IRC23	Q08416	YMR158W-B	YMR158W-B	321 nt		-0.32	□□□□□ -2.46
IRC23	Q08416	YBR099C	YBR099C	384 nt		-0.34	□□□□□ -2.46
IRC23	Q08416	SBH2	YER019C-A	267 nt		-0.35	□□□□□ -2.47
IRC23	Q08416	YJL197C-A	YJL197C-A	282 nt		-0.35	□□□□□ -2.47
IRC23	Q08416	AGA2	YGL032C	264 nt		-0.36	□□□□□ -2.47
IRC23	Q08416	YLL019W-A	YLL019W-A	93 nt		-0.36	□□□□□ -2.47
IRC23	Q08416	BIL1	YOR304C-A	231 nt		-0.36	□□□□□ -2.47
IRC23	Q08416	RAD61	YDR014W	1944 nt		-0.36	□□□□□ -2.47
IRC23	Q08416	YGR069W	YGR069W	336 nt		-0.38	□□□□□ -2.47
IRC23	Q08416	YNL324W	YNL324W	396 nt		-0.38	□□□□□ -2.47
IRC23	Q08416	YMR193C-A	YMR193C-A	387 nt		-0.39	□□□□□ -2.47
IRC23	Q08416	GLG1	YKR058W	1851 nt		-0.39	□□□□□ -2.47
IRC23	Q08416	SEC10	YLR166C	2616 nt		-0.4	□□□□□ -2.47
IRC23	Q08416	YER053C-A	YER053C-A	114 nt		-0.4	□□□□□ -2.47
IRC23	Q08416	EST1	YLR233C	2100 nt		-0.41	□□□□□ -2.47
IRC23	Q08416	snR60	snR60	104 nt		-0.41	□□□□□ -2.48
IRC23	Q08416	YPR016W-A	YPR016W-A	261 nt		-0.41	□□□□□ -2.48
IRC23	Q08416	SDH6	YDR379C-A	240 nt		-0.44	□□□□□ -2.48
IRC23	Q08416	YAL068W-A	YAL068W-A	255 nt		-0.44	□□□□□ -2.48
IRC23	Q08416	YAL063C-A	YAL063C-A	291 nt		-0.45	□□□□□ -2.48
IRC23	Q08416	YGR035C	YGR035C	351 nt		-0.46	□□□□□ -2.48
IRC23	Q08416	YJR157W	YJR157W	363 nt		-0.46	□□□□□ -2.48
IRC23	Q08416	YLR264C-A	YLR264C-A	117 nt		-0.46	□□□□□ -2.48
IRC23	Q08416	YOR072W-B	YOR072W-B	162 nt		-0.46	□□□□□ -2.48
IRC23	Q08416	YPR170W-A	YPR170W-A	186 nt		-0.47	□□□□□ -2.48
IRC23	Q08416	YIL032C	YIL032C	357 nt		-0.49	□□□□□ -2.49
IRC23	Q08416	YOR293C-A	YOR293C-A	150 nt		-0.49	□□□□□ -2.49
IRC23	Q08416	HTL1	YCR020W-B	237 nt		-0.5	□□□□□ -2.49
IRC23	Q08416	TAH1	YCR060W	336 nt		-0.5	□□□□□ -2.49
IRC23	Q08416	YIL002W-A	YIL002W-A	210 nt		-0.5	□□□□□ -2.49
IRC23	Q08416	APQ12	YIL040W	417 nt		-0.5	□□□□□ -2.49
IRC23	Q08416	HMRA1	YCR097W	381 nt		-0.51	□□□□□ -2.49
IRC23	Q08416	URB1	YKL014C	5295 nt		-0.52	□□□□□ -2.49
IRC23	Q08416	YNL028W	YNL028W	318 nt		-0.52	□□□□□ -2.49
IRC23	Q08416	Q0017	Q0017	162 nt		-0.53	□□□□□ -2.49
IRC23	Q08416	YCR038W-A	YCR038W-A	126 nt		-0.54	□□□□□ -2.5
IRC23	Q08416	YIR030W-A	YIR030W-A	384 nt		-0.54	□□□□□ -2.5
IRC23	Q08416	RPM2	YML091C	3609 nt		-0.54	□□□□□ -2.5
IRC23	Q08416	YJL113W	YJL113W	4647 nt		-0.56	□□□□□ -2.5
IRC23	Q08416	YNL067W-B	YNL067W-B	141 nt		-0.56	□□□□□ -2.5
IRC23	Q08416	YPL060C-A	YPL060C-A	3315 nt		-0.57	□□□□□ -2.5
IRC23	Q08416	YDR544C	YDR544C	429 nt		-0.57	□□□□□ -2.5
IRC23	Q08416	YLR154W-F	YLR154W-F	141 nt		-0.59	□□□□□ -2.5
IRC23	Q08416	YOR015W	YOR015W	360 nt		-0.59	□□□□□ -2.5
IRC23	Q08416	COG6	YNL041C	2520 nt		-0.59	□□□□□ -2.5
IRC23	Q08416	YDL007C-A	YDL007C-A	258 nt		-0.61	□□□□□ -2.51
IRC23	Q08416	YIL071W-A	YIL071W-A	477 nt		-0.61	□□□□□ -2.51
IRC23	Q08416	YLR120W-A	YLR120W-A	102 nt		-0.61	□□□□□ -2.51
IRC23	Q08416	snR36	snR36	182 nt		-0.61	□□□□□ -2.51
IRC23	Q08416	YDR102C	YDR102C	333 nt		-0.62	□□□□□ -2.51
IRC23	Q08416	YGL149W	YGL149W	306 nt		-0.63	□□□□□ -2.51
IRC23	Q08416	snR74	snR74	88 nt		-0.64	□□□□□ -2.51
IRC23	Q08416	YAF9	YNL107W	681 nt		-0.64	□□□□□ -2.51
IRC23	Q08416	ATP6	Q0085	780 nt		-0.65	□□□□□ -2.51
IRC23	Q08416	YDR183C-A	YDR183C-A	258 nt		-0.66	□□□□□ -2.52
IRC23	Q08416	tT(UGU)G1	tT(UGU)G1	72 nt		-0.67	□□□□□ -2.52
IRC23	Q08416	tT(UGU)G2	tT(UGU)G2	72 nt		-0.67	□□□□□ -2.52
IRC23	Q08416	tT(UGU)P	tT(UGU)P	72 nt		-0.67	□□□□□ -2.52
IRC23	Q08416	YML100W-A	YML100W-A	174 nt		-0.68	□□□□□ -2.52
IRC23	Q08416	YBL039C-A	YBL039C-A	84 nt		-0.69	□□□□□ -2.52
IRC23	Q08416	tA(UGC)Q	tA(UGC)Q	76 nt		-0.7	□□□□□ -2.52
IRC23	Q08416	YDR157W	YDR157W	402 nt		-0.7	□□□□□ -2.52
IRC23	Q08416	YOR314W-A	YOR314W-A	111 nt		-0.7	□□□□□ -2.52
IRC23	Q08416	snR33	snR33	183 nt		-0.7	□□□□□ -2.52
IRC23	Q08416	YMR172C-A	YMR172C-A	384 nt		-0.71	□□□□□ -2.52
IRC23	Q08416	YGL052W	YGL052W	306 nt		-0.72	□□□□□ -2.52
IRC23	Q08416	YLR222C-A	YLR222C-A	231 nt		-0.73	□□□□□ -2.53
IRC23	Q08416	YML099W-A	YML099W-A	330 nt		-0.73	□□□□□ -2.53
IRC23	Q08416	snR161	snR161	161 nt		-0.74	□□□□□ -2.53
IRC23	Q08416	YPL038W-A	YPL038W-A	192 nt		-0.74	□□□□□ -2.53
IRC23	Q08416	YJL077W-A	YJL077W-A	87 nt		-0.75	□□□□□ -2.53
IRC23	Q08416	YHL009W-B	YHL009W-B	5409 nt		-0.76	□□□□□ -2.53
IRC23	Q08416	PAU9	YBL108C-A	129 nt		-0.76	□□□□□ -2.53
IRC23	Q08416	YGL182C	YGL182C	324 nt		-0.79	□□□□□ -2.54
IRC23	Q08416	YPR197C	YPR197C	564 nt		-0.79	□□□□□ -2.54
IRC23	Q08416	YFL032W	YFL032W	321 nt		-0.8	□□□□□ -2.54
IRC23	Q08416	YOR008C-A	YOR008C-A	225 nt		-0.82	□□□□□ -2.54
IRC23	Q08416	YGL041C	YGL041C	204 nt		-0.83	□□□□□ -2.54
IRC23	Q08416	tQ(UUG)Q	tQ(UUG)Q	76 nt		-0.83	□□□□□ -2.54
IRC23	Q08416	YOR170W	YOR170W	306 nt		-0.84	□□□□□ -2.54
IRC23	Q08416	YBR182C-A	YBR182C-A	195 nt		-0.85	□□□□□ -2.55
IRC23	Q08416	YDR118W-A	YDR118W-A	117 nt		-0.86	□□□□□ -2.55
IRC23	Q08416	YPR010C-A	YPR010C-A	219 nt		-0.86	□□□□□ -2.55
IRC23	Q08416	VAR1	Q0140	1197 nt		-0.87	□□□□□ -2.55
IRC23	Q08416	RPL39	YJL189W	156 nt		-0.87	□□□□□ -2.55
IRC23	Q08416	snR69	snR69	101 nt		-0.89	□□□□□ -2.55
IRC23	Q08416	YDL240C-A	YDL240C-A	138 nt		-0.89	□□□□□ -2.55
IRC23	Q08416	YJL182C	YJL182C	318 nt		-0.89	□□□□□ -2.55
IRC23	Q08416	YDR413C	YDR413C	576 nt		-0.91	□□□□□ -2.56
IRC23	Q08416	snR49	snR49	165 nt		-0.91	□□□□□ -2.56
IRC23	Q08416	YER097W	YER097W	330 nt		-0.93	□□□□□ -2.56
IRC23	Q08416	YOR381W-A	YOR381W-A	168 nt		-0.93	□□□□□ -2.56
IRC23	Q08416	YBR223W-A	YBR223W-A	120 nt		-0.93	□□□□□ -2.56
IRC23	Q08416	tF(GAA)Q	tF(GAA)Q	75 nt		-0.94	□□□□□ -2.56
IRC23	Q08416	YER090C-A	YER090C-A	90 nt		-0.94	□□□□□ -2.56

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.6 ms