Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK18Q07002 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK18Q07002 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK18Q07002 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK18Q07002 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK18Q07002 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK18Q07002 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK18Q07002 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK18Q07002 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK18Q07002 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK18Q07002 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK18Q07002 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK18Q07002 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK18Q07002 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK18Q07002 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK18Q07002 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK18Q07002 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK18Q07002 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK18Q07002 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK18Q07002 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK18Q07002 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK18Q07002 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK18Q07002 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms