Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GBE1Q04446 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms