Protein–RNA interactions for Protein: Q04437

YKU80, ATP-dependent DNA helicase II subunit 2, yeastyeast

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKU80Q04437 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.85□□□□□ -2.27
YKU80Q04437 SEC1YDR164C 2175 nt0.84□□□□□ -2.27
YKU80Q04437 YML002WYML002W 2214 nt0.84□□□□□ -2.27
YKU80Q04437 UBP3YER151C 2739 nt0.84□□□□□ -2.27
YKU80Q04437 UTP8YGR128C 2142 nt0.84□□□□□ -2.27
YKU80Q04437 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.84□□□□□ -2.27
YKU80Q04437 COX12YLR038C 252 nt0.84□□□□□ -2.27
YKU80Q04437 YNL198CYNL198C 303 nt0.84□□□□□ -2.27
YKU80Q04437 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt0.83□□□□□ -2.28
YKU80Q04437 YER053C-AYER053C-A 114 nt0.82□□□□□ -2.28
YKU80Q04437 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.82□□□□□ -2.28
YKU80Q04437 CHS6YJL099W 2241 nt0.81□□□□□ -2.28
YKU80Q04437 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt0.81□□□□□ -2.28
YKU80Q04437 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt0.79□□□□□ -2.28
YKU80Q04437 YJL182CYJL182C 318 nt0.79□□□□□ -2.28
YKU80Q04437 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.79□□□□□ -2.28
YKU80Q04437 BEM3YPL115C 3387 nt0.78□□□□□ -2.28
YKU80Q04437 YJL150WYJL150W 303 nt0.78□□□□□ -2.28
YKU80Q04437 PRP5YBR237W 2550 nt0.78□□□□□ -2.28
YKU80Q04437 FYV10YIL097W 1551 nt0.78□□□□□ -2.29
YKU80Q04437 YEL073CYEL073C 324 nt0.77□□□□□ -2.29
YKU80Q04437 YGR151CYGR151C 336 nt0.77□□□□□ -2.29
YKU80Q04437 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt0.77□□□□□ -2.29
YKU80Q04437 PRP42YDR235W 1635 nt0.75□□□□□ -2.29
YKU80Q04437 snR46snR46 197 nt0.75□□□□□ -2.29
YKU80Q04437 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.74□□□□□ -2.29
YKU80Q04437 HAL9YOL089C 3093 nt0.74□□□□□ -2.29
YKU80Q04437 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.72□□□□□ -2.29
YKU80Q04437 YNL338WYNL338W 159 nt0.72□□□□□ -2.29
YKU80Q04437 PRP39YML046W 1890 nt0.71□□□□□ -2.3
YKU80Q04437 PET111YMR257C 2403 nt0.7□□□□□ -2.3
YKU80Q04437 OST4YDL232W 111 nt0.7□□□□□ -2.3
YKU80Q04437 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.7□□□□□ -2.3
YKU80Q04437 TRS65YGR166W 1683 nt0.69□□□□□ -2.3
YKU80Q04437 TAH1YCR060W 336 nt0.69□□□□□ -2.3
YKU80Q04437 YDR544CYDR544C 429 nt0.69□□□□□ -2.3
YKU80Q04437 UTP10YJL109C 5310 nt0.68□□□□□ -2.3
YKU80Q04437 YLR232WYLR232W 348 nt0.68□□□□□ -2.3
YKU80Q04437 YGL182CYGL182C 324 nt0.66□□□□□ -2.3
YKU80Q04437 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.66□□□□□ -2.3
YKU80Q04437 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.66□□□□□ -2.3
YKU80Q04437 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.66□□□□□ -2.3
YKU80Q04437 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.66□□□□□ -2.3
YKU80Q04437 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.66□□□□□ -2.3
YKU80Q04437 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.66□□□□□ -2.3
YKU80Q04437 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.66□□□□□ -2.3
YKU80Q04437 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.66□□□□□ -2.3
YKU80Q04437 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.66□□□□□ -2.3
YKU80Q04437 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.66□□□□□ -2.3
YKU80Q04437 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.66□□□□□ -2.3
YKU80Q04437 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.66□□□□□ -2.3
YKU80Q04437 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.66□□□□□ -2.3
YKU80Q04437 MLP1YKR095W 5628 nt0.66□□□□□ -2.3
YKU80Q04437 Q0032Q0032 291 nt0.65□□□□□ -2.31
YKU80Q04437 SNU13YEL026W 381 nt0.65□□□□□ -2.31
YKU80Q04437 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt0.65□□□□□ -2.31
YKU80Q04437 YLR041WYLR041W 321 nt0.65□□□□□ -2.31
YKU80Q04437 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt0.65□□□□□ -2.31
YKU80Q04437 YSP1YHR155W 3687 nt0.65□□□□□ -2.31
YKU80Q04437 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt0.64□□□□□ -2.31
YKU80Q04437 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt0.64□□□□□ -2.31
YKU80Q04437 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.62□□□□□ -2.31
YKU80Q04437 NNF2YGR089W 2811 nt0.62□□□□□ -2.31
YKU80Q04437 MYO1YHR023W 5787 nt0.62□□□□□ -2.31
YKU80Q04437 STF2YGR008C 255 nt0.6□□□□□ -2.31
YKU80Q04437 YOR225WYOR225W 330 nt0.6□□□□□ -2.31
YKU80Q04437 IQG1YPL242C 4488 nt0.6□□□□□ -2.31
YKU80Q04437 YOR102WYOR102W 351 nt0.59□□□□□ -2.31
YKU80Q04437 YBL053WYBL053W 375 nt0.58□□□□□ -2.32
YKU80Q04437 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.58□□□□□ -2.32
YKU80Q04437 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt0.57□□□□□ -2.32
YKU80Q04437 PAU12YGR294W 363 nt0.57□□□□□ -2.32
YKU80Q04437 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.57□□□□□ -2.32
YKU80Q04437 SBH1YER087C-B 249 nt0.56□□□□□ -2.32
YKU80Q04437 YLR294CYLR294C 330 nt0.56□□□□□ -2.32
YKU80Q04437 HUG1YML058W-A 207 nt0.56□□□□□ -2.32
YKU80Q04437 YOR170WYOR170W 306 nt0.56□□□□□ -2.32
YKU80Q04437 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt0.56□□□□□ -2.32
YKU80Q04437 CSE1YGL238W 2883 nt0.56□□□□□ -2.32
YKU80Q04437 SDH6YDR379C-A 240 nt0.55□□□□□ -2.32
YKU80Q04437 COG6YNL041C 2520 nt0.54□□□□□ -2.32
YKU80Q04437 QCR9YGR183C 201 nt0.53□□□□□ -2.32
YKU80Q04437 MLP2YIL149C 5040 nt0.53□□□□□ -2.32
YKU80Q04437 YMR160WYMR160W 2451 nt0.53□□□□□ -2.33
YKU80Q04437 YDR210WYDR210W 228 nt0.52□□□□□ -2.33
YKU80Q04437 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt0.51□□□□□ -2.33
YKU80Q04437 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt0.51□□□□□ -2.33
YKU80Q04437 snR48snR48 113 nt0.51□□□□□ -2.33
YKU80Q04437 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.49□□□□□ -2.33
YKU80Q04437 snR39BsnR39B 96 nt0.49□□□□□ -2.33
YKU80Q04437 GLG1YKR058W 1851 nt0.49□□□□□ -2.33
YKU80Q04437 RPS26AYGL189C 360 nt0.48□□□□□ -2.33
YKU80Q04437 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt0.47□□□□□ -2.33
YKU80Q04437 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt0.47□□□□□ -2.33
YKU80Q04437 UTP20YBL004W 7482 nt0.47□□□□□ -2.33
YKU80Q04437 BIR1YJR089W 2865 nt0.45□□□□□ -2.34
YKU80Q04437 NIP1YMR309C 2439 nt0.45□□□□□ -2.34
YKU80Q04437 ORC3YLL004W 1851 nt0.44□□□□□ -2.34
YKU80Q04437 BUL2YML111W 2763 nt0.44□□□□□ -2.34
YKU80Q04437 ULP2YIL031W 3105 nt0.41□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.1 ms