Protein–RNA interactions for Protein: Q04264

PDS5, Sister chromatid cohesion protein PDS5, yeastyeast

Predictions only

Length 1,277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDS5Q04264 COX12YLR038C 252 nt0.86□□□□□ -2.27
PDS5Q04264 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt0.86□□□□□ -2.27
PDS5Q04264 snR190snR190 190 nt0.86□□□□□ -2.27
PDS5Q04264 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt0.85□□□□□ -2.27
PDS5Q04264 ULI1YFR026C 510 nt0.83□□□□□ -2.28
PDS5Q04264 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.83□□□□□ -2.28
PDS5Q04264 YLR282CYLR282C 342 nt0.83□□□□□ -2.28
PDS5Q04264 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.83□□□□□ -2.28
PDS5Q04264 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.83□□□□□ -2.28
PDS5Q04264 YMR160WYMR160W 2451 nt0.83□□□□□ -2.28
PDS5Q04264 YER053C-AYER053C-A 114 nt0.82□□□□□ -2.28
PDS5Q04264 APQ12YIL040W 417 nt0.82□□□□□ -2.28
PDS5Q04264 HAL9YOL089C 3093 nt0.82□□□□□ -2.28
PDS5Q04264 JLP2YMR132C 627 nt0.81□□□□□ -2.28
PDS5Q04264 CHS6YJL099W 2241 nt0.8□□□□□ -2.28
PDS5Q04264 COX5BYIL111W 456 nt0.8□□□□□ -2.28
PDS5Q04264 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.8□□□□□ -2.28
PDS5Q04264 SPG3YDR504C 384 nt0.78□□□□□ -2.28
PDS5Q04264 YEL014CYEL014C 306 nt0.78□□□□□ -2.28
PDS5Q04264 BLI1YKL061W 342 nt0.78□□□□□ -2.28
PDS5Q04264 FYV10YIL097W 1551 nt0.78□□□□□ -2.29
PDS5Q04264 PRP5YBR237W 2550 nt0.77□□□□□ -2.29
PDS5Q04264 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.77□□□□□ -2.29
PDS5Q04264 LTE1YAL024C 4308 nt0.76□□□□□ -2.29
PDS5Q04264 YML002WYML002W 2214 nt0.76□□□□□ -2.29
PDS5Q04264 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt0.76□□□□□ -2.29
PDS5Q04264 YLR041WYLR041W 321 nt0.74□□□□□ -2.29
PDS5Q04264 YJL182CYJL182C 318 nt0.73□□□□□ -2.29
PDS5Q04264 OST4YDL232W 111 nt0.72□□□□□ -2.29
PDS5Q04264 BEM3YPL115C 3387 nt0.72□□□□□ -2.29
PDS5Q04264 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.71□□□□□ -2.3
PDS5Q04264 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.71□□□□□ -2.3
PDS5Q04264 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.71□□□□□ -2.3
PDS5Q04264 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.71□□□□□ -2.3
PDS5Q04264 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.71□□□□□ -2.3
PDS5Q04264 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.71□□□□□ -2.3
PDS5Q04264 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.71□□□□□ -2.3
PDS5Q04264 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.71□□□□□ -2.3
PDS5Q04264 snR52snR52 92 nt0.71□□□□□ -2.3
PDS5Q04264 PRP42YDR235W 1635 nt0.71□□□□□ -2.3
PDS5Q04264 UTP20YBL004W 7482 nt0.7□□□□□ -2.3
PDS5Q04264 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt0.69□□□□□ -2.3
PDS5Q04264 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.69□□□□□ -2.3
PDS5Q04264 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.69□□□□□ -2.3
PDS5Q04264 snR46snR46 197 nt0.69□□□□□ -2.3
PDS5Q04264 PRP39YML046W 1890 nt0.68□□□□□ -2.3
PDS5Q04264 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt0.68□□□□□ -2.3
PDS5Q04264 FMP27YLR454W 7887 nt0.68□□□□□ -2.3
PDS5Q04264 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.68□□□□□ -2.3
PDS5Q04264 YJL150WYJL150W 303 nt0.67□□□□□ -2.3
PDS5Q04264 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.67□□□□□ -2.3
PDS5Q04264 UTP8YGR128C 2142 nt0.65□□□□□ -2.3
PDS5Q04264 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt0.65□□□□□ -2.31
PDS5Q04264 QCR9YGR183C 201 nt0.65□□□□□ -2.31
PDS5Q04264 YSP1YHR155W 3687 nt0.65□□□□□ -2.31
PDS5Q04264 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.64□□□□□ -2.31
PDS5Q04264 ULP2YIL031W 3105 nt0.63□□□□□ -2.31
PDS5Q04264 TAH1YCR060W 336 nt0.63□□□□□ -2.31
PDS5Q04264 YDR544CYDR544C 429 nt0.63□□□□□ -2.31
PDS5Q04264 SNU13YEL026W 381 nt0.63□□□□□ -2.31
PDS5Q04264 TRS65YGR166W 1683 nt0.62□□□□□ -2.31
PDS5Q04264 YNL198CYNL198C 303 nt0.62□□□□□ -2.31
PDS5Q04264 UTP10YJL109C 5310 nt0.62□□□□□ -2.31
PDS5Q04264 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt0.61□□□□□ -2.31
PDS5Q04264 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.6□□□□□ -2.31
PDS5Q04264 PET111YMR257C 2403 nt0.6□□□□□ -2.31
PDS5Q04264 YGL182CYGL182C 324 nt0.59□□□□□ -2.31
PDS5Q04264 YLR232WYLR232W 348 nt0.59□□□□□ -2.31
PDS5Q04264 YEL073CYEL073C 324 nt0.57□□□□□ -2.32
PDS5Q04264 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt0.57□□□□□ -2.32
PDS5Q04264 MLP1YKR095W 5628 nt0.57□□□□□ -2.32
PDS5Q04264 NNF2YGR089W 2811 nt0.57□□□□□ -2.32
PDS5Q04264 PAU12YGR294W 363 nt0.56□□□□□ -2.32
PDS5Q04264 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt0.56□□□□□ -2.32
PDS5Q04264 IQG1YPL242C 4488 nt0.54□□□□□ -2.32
PDS5Q04264 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.53□□□□□ -2.32
PDS5Q04264 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt0.52□□□□□ -2.33
PDS5Q04264 RPM2YML091C 3609 nt0.52□□□□□ -2.33
PDS5Q04264 SDH6YDR379C-A 240 nt0.51□□□□□ -2.33
PDS5Q04264 ORC3YLL004W 1851 nt0.51□□□□□ -2.33
PDS5Q04264 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.51□□□□□ -2.33
PDS5Q04264 YBL053WYBL053W 375 nt0.51□□□□□ -2.33
PDS5Q04264 YOL014WYOL014W 375 nt0.51□□□□□ -2.33
PDS5Q04264 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.5□□□□□ -2.33
PDS5Q04264 SBH1YER087C-B 249 nt0.5□□□□□ -2.33
PDS5Q04264 RPS26AYGL189C 360 nt0.5□□□□□ -2.33
PDS5Q04264 NIP1YMR309C 2439 nt0.5□□□□□ -2.33
PDS5Q04264 YGR151CYGR151C 336 nt0.49□□□□□ -2.33
PDS5Q04264 BUL2YML111W 2763 nt0.49□□□□□ -2.33
PDS5Q04264 COG6YNL041C 2520 nt0.48□□□□□ -2.33
PDS5Q04264 YNL337WYNL337W 255 nt0.47□□□□□ -2.33
PDS5Q04264 YOR170WYOR170W 306 nt0.47□□□□□ -2.33
PDS5Q04264 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt0.46□□□□□ -2.34
PDS5Q04264 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt0.45□□□□□ -2.34
PDS5Q04264 YNL338WYNL338W 159 nt0.45□□□□□ -2.34
PDS5Q04264 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt0.44□□□□□ -2.34
PDS5Q04264 snR39BsnR39B 96 nt0.44□□□□□ -2.34
PDS5Q04264 GLG1YKR058W 1851 nt0.44□□□□□ -2.34
PDS5Q04264 MLP2YIL149C 5040 nt0.43□□□□□ -2.34
PDS5Q04264 AI1Q0050 2505 nt0.42□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 41.1 ms