Protein–RNA interactions for Protein: Q03557

HER2, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HER2Q03557 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.9□□□□□ -2.27
HER2Q03557 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.9□□□□□ -2.27
HER2Q03557 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt0.9□□□□□ -2.27
HER2Q03557 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt0.89□□□□□ -2.27
HER2Q03557 YER053C-AYER053C-A 114 nt0.89□□□□□ -2.27
HER2Q03557 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.89□□□□□ -2.27
HER2Q03557 YLR282CYLR282C 342 nt0.88□□□□□ -2.27
HER2Q03557 YEL014CYEL014C 306 nt0.87□□□□□ -2.27
HER2Q03557 RPL26BYGR034W 384 nt0.87□□□□□ -2.27
HER2Q03557 snR190snR190 190 nt0.87□□□□□ -2.27
HER2Q03557 HAL9YOL089C 3093 nt0.87□□□□□ -2.27
HER2Q03557 YDL073WYDL073W 2955 nt0.85□□□□□ -2.27
HER2Q03557 PMP1YCR024C-A 123 nt0.85□□□□□ -2.27
HER2Q03557 YNL198CYNL198C 303 nt0.85□□□□□ -2.27
HER2Q03557 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt0.84□□□□□ -2.27
HER2Q03557 YJL150WYJL150W 303 nt0.84□□□□□ -2.27
HER2Q03557 YJL182CYJL182C 318 nt0.84□□□□□ -2.27
HER2Q03557 snR46snR46 197 nt0.84□□□□□ -2.27
HER2Q03557 snR52snR52 92 nt0.84□□□□□ -2.27
HER2Q03557 PRP16YKR086W 3216 nt0.82□□□□□ -2.28
HER2Q03557 COX5BYIL111W 456 nt0.82□□□□□ -2.28
HER2Q03557 FYV10YIL097W 1551 nt0.8□□□□□ -2.28
HER2Q03557 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.8□□□□□ -2.28
HER2Q03557 YML002WYML002W 2214 nt0.79□□□□□ -2.28
HER2Q03557 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.79□□□□□ -2.28
HER2Q03557 YMR160WYMR160W 2451 nt0.79□□□□□ -2.28
HER2Q03557 UTP20YBL004W 7482 nt0.79□□□□□ -2.28
HER2Q03557 PRP39YML046W 1890 nt0.78□□□□□ -2.28
HER2Q03557 YLR041WYLR041W 321 nt0.78□□□□□ -2.28
HER2Q03557 PRP5YBR237W 2550 nt0.77□□□□□ -2.29
HER2Q03557 PRP42YDR235W 1635 nt0.77□□□□□ -2.29
HER2Q03557 SEC8YPR055W 3198 nt0.77□□□□□ -2.29
HER2Q03557 CHS6YJL099W 2241 nt0.76□□□□□ -2.29
HER2Q03557 YNL337WYNL337W 255 nt0.76□□□□□ -2.29
HER2Q03557 YOL014WYOL014W 375 nt0.76□□□□□ -2.29
HER2Q03557 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.75□□□□□ -2.29
HER2Q03557 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.75□□□□□ -2.29
HER2Q03557 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.75□□□□□ -2.29
HER2Q03557 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.75□□□□□ -2.29
HER2Q03557 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.75□□□□□ -2.29
HER2Q03557 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.75□□□□□ -2.29
HER2Q03557 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.75□□□□□ -2.29
HER2Q03557 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.75□□□□□ -2.29
HER2Q03557 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.75□□□□□ -2.29
HER2Q03557 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.75□□□□□ -2.29
HER2Q03557 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.75□□□□□ -2.29
HER2Q03557 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.75□□□□□ -2.29
HER2Q03557 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt0.74□□□□□ -2.29
HER2Q03557 SEC1YDR164C 2175 nt0.73□□□□□ -2.29
HER2Q03557 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.73□□□□□ -2.29
HER2Q03557 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.73□□□□□ -2.29
HER2Q03557 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt0.72□□□□□ -2.29
HER2Q03557 UTP8YGR128C 2142 nt0.71□□□□□ -2.3
HER2Q03557 YEL073CYEL073C 324 nt0.71□□□□□ -2.3
HER2Q03557 TAH1YCR060W 336 nt0.7□□□□□ -2.3
HER2Q03557 OST4YDL232W 111 nt0.7□□□□□ -2.3
HER2Q03557 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt0.7□□□□□ -2.3
HER2Q03557 YGR151CYGR151C 336 nt0.69□□□□□ -2.3
HER2Q03557 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.69□□□□□ -2.3
HER2Q03557 TRS65YGR166W 1683 nt0.69□□□□□ -2.3
HER2Q03557 LTE1YAL024C 4308 nt0.68□□□□□ -2.3
HER2Q03557 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.68□□□□□ -2.3
HER2Q03557 YDR544CYDR544C 429 nt0.68□□□□□ -2.3
HER2Q03557 YGL182CYGL182C 324 nt0.68□□□□□ -2.3
HER2Q03557 SNU13YEL026W 381 nt0.67□□□□□ -2.3
HER2Q03557 YBL053WYBL053W 375 nt0.66□□□□□ -2.3
HER2Q03557 YNL338WYNL338W 159 nt0.66□□□□□ -2.3
HER2Q03557 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt0.66□□□□□ -2.3
HER2Q03557 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt0.65□□□□□ -2.31
HER2Q03557 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.65□□□□□ -2.31
HER2Q03557 YLR232WYLR232W 348 nt0.65□□□□□ -2.31
HER2Q03557 YOR225WYOR225W 330 nt0.65□□□□□ -2.31
HER2Q03557 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.63□□□□□ -2.31
HER2Q03557 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.62□□□□□ -2.31
HER2Q03557 Q0032Q0032 291 nt0.59□□□□□ -2.31
HER2Q03557 ULP2YIL031W 3105 nt0.59□□□□□ -2.32
HER2Q03557 BEM3YPL115C 3387 nt0.58□□□□□ -2.32
HER2Q03557 YOR170WYOR170W 306 nt0.58□□□□□ -2.32
HER2Q03557 YSP1YHR155W 3687 nt0.58□□□□□ -2.32
HER2Q03557 NNF2YGR089W 2811 nt0.58□□□□□ -2.32
HER2Q03557 SDH6YDR379C-A 240 nt0.57□□□□□ -2.32
HER2Q03557 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt0.57□□□□□ -2.32
HER2Q03557 UTP10YJL109C 5310 nt0.57□□□□□ -2.32
HER2Q03557 FMP27YLR454W 7887 nt0.57□□□□□ -2.32
HER2Q03557 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.56□□□□□ -2.32
HER2Q03557 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt0.56□□□□□ -2.32
HER2Q03557 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.56□□□□□ -2.32
HER2Q03557 snR48snR48 113 nt0.56□□□□□ -2.32
HER2Q03557 COG6YNL041C 2520 nt0.56□□□□□ -2.32
HER2Q03557 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt0.55□□□□□ -2.32
HER2Q03557 YOR102WYOR102W 351 nt0.54□□□□□ -2.32
HER2Q03557 snR39BsnR39B 96 nt0.54□□□□□ -2.32
HER2Q03557 PET111YMR257C 2403 nt0.54□□□□□ -2.32
HER2Q03557 BUL2YML111W 2763 nt0.53□□□□□ -2.32
HER2Q03557 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt0.53□□□□□ -2.32
HER2Q03557 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.52□□□□□ -2.33
HER2Q03557 RPS26AYGL189C 360 nt0.52□□□□□ -2.33
HER2Q03557 YLR294CYLR294C 330 nt0.52□□□□□ -2.33
HER2Q03557 ORC3YLL004W 1851 nt0.52□□□□□ -2.33
HER2Q03557 NIP1YMR309C 2439 nt0.52□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.4 ms