Protein–RNA interactions for Protein: P39959

YER130C, Zinc finger protein YER130C, yeastyeast

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YER130CP39959 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt1.07□□□□□ -2.24
YER130CP39959 PRP5YBR237W 2550 nt1.06□□□□□ -2.24
YER130CP39959 CLU1YMR012W 3834 nt1.06□□□□□ -2.24
YER130CP39959 YML002WYML002W 2214 nt1.06□□□□□ -2.24
YER130CP39959 COX5BYIL111W 456 nt1.06□□□□□ -2.24
YER130CP39959 snR190snR190 190 nt1.05□□□□□ -2.24
YER130CP39959 NST1YNL091W 3723 nt1.05□□□□□ -2.24
YER130CP39959 PRP42YDR235W 1635 nt1.04□□□□□ -2.24
YER130CP39959 YJR029WYJR029W 5268 nt1.04□□□□□ -2.24
YER130CP39959 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.04□□□□□ -2.24
YER130CP39959 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt1.04□□□□□ -2.24
YER130CP39959 DOP1YDR141C 5097 nt1.03□□□□□ -2.24
YER130CP39959 PAU24YBR301W 363 nt1.02□□□□□ -2.25
YER130CP39959 PRP16YKR086W 3216 nt1.01□□□□□ -2.25
YER130CP39959 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.01□□□□□ -2.25
YER130CP39959 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.01□□□□□ -2.25
YER130CP39959 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.01□□□□□ -2.25
YER130CP39959 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.01□□□□□ -2.25
YER130CP39959 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.01□□□□□ -2.25
YER130CP39959 BFR2YDR299W 1605 nt1□□□□□ -2.25
YER130CP39959 KAP120YPL125W 3099 nt1□□□□□ -2.25
YER130CP39959 FYV10YIL097W 1551 nt1□□□□□ -2.25
YER130CP39959 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt0.99□□□□□ -2.25
YER130CP39959 SEC8YPR055W 3198 nt0.98□□□□□ -2.25
YER130CP39959 BUD3YCL014W 4911 nt0.96□□□□□ -2.26
YER130CP39959 TAH1YCR060W 336 nt0.95□□□□□ -2.26
YER130CP39959 BEM3YPL115C 3387 nt0.95□□□□□ -2.26
YER130CP39959 YGL182CYGL182C 324 nt0.94□□□□□ -2.26
YER130CP39959 YOR102WYOR102W 351 nt0.94□□□□□ -2.26
YER130CP39959 YDL073WYDL073W 2955 nt0.93□□□□□ -2.26
YER130CP39959 ASE1YOR058C 2658 nt0.93□□□□□ -2.26
YER130CP39959 YLR232WYLR232W 348 nt0.92□□□□□ -2.26
YER130CP39959 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.92□□□□□ -2.26
YER130CP39959 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt0.91□□□□□ -2.26
YER130CP39959 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt0.9□□□□□ -2.27
YER130CP39959 PAU12YGR294W 363 nt0.9□□□□□ -2.27
YER130CP39959 YLR041WYLR041W 321 nt0.9□□□□□ -2.27
YER130CP39959 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.9□□□□□ -2.27
YER130CP39959 YPR117WYPR117W 7470 nt0.9□□□□□ -2.27
YER130CP39959 UBP3YER151C 2739 nt0.89□□□□□ -2.27
YER130CP39959 RKR1YMR247C 4689 nt0.89□□□□□ -2.27
YER130CP39959 CHS6YJL099W 2241 nt0.88□□□□□ -2.27
YER130CP39959 YBL053WYBL053W 375 nt0.88□□□□□ -2.27
YER130CP39959 YOR170WYOR170W 306 nt0.88□□□□□ -2.27
YER130CP39959 YDR544CYDR544C 429 nt0.87□□□□□ -2.27
YER130CP39959 SNU13YEL026W 381 nt0.87□□□□□ -2.27
YER130CP39959 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.87□□□□□ -2.27
YER130CP39959 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt0.87□□□□□ -2.27
YER130CP39959 SEC1YDR164C 2175 nt0.86□□□□□ -2.27
YER130CP39959 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.86□□□□□ -2.27
YER130CP39959 snR48snR48 113 nt0.85□□□□□ -2.27
YER130CP39959 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt0.84□□□□□ -2.27
YER130CP39959 QCR9YGR183C 201 nt0.84□□□□□ -2.27
YER130CP39959 Q0092Q0092 141 nt0.83□□□□□ -2.28
YER130CP39959 YGR164WYGR164W 336 nt0.83□□□□□ -2.28
YER130CP39959 YSP1YHR155W 3687 nt0.82□□□□□ -2.28
YER130CP39959 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.82□□□□□ -2.28
YER130CP39959 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.81□□□□□ -2.28
YER130CP39959 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.81□□□□□ -2.28
YER130CP39959 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.81□□□□□ -2.28
YER130CP39959 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.81□□□□□ -2.28
YER130CP39959 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.81□□□□□ -2.28
YER130CP39959 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.81□□□□□ -2.28
YER130CP39959 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.81□□□□□ -2.28
YER130CP39959 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.81□□□□□ -2.28
YER130CP39959 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt0.81□□□□□ -2.28
YER130CP39959 ATP8Q0080 147 nt0.8□□□□□ -2.28
YER130CP39959 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt0.8□□□□□ -2.28
YER130CP39959 YNL170WYNL170W 396 nt0.79□□□□□ -2.28
YER130CP39959 OST4YDL232W 111 nt0.78□□□□□ -2.28
YER130CP39959 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.77□□□□□ -2.29
YER130CP39959 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.77□□□□□ -2.29
YER130CP39959 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.77□□□□□ -2.29
YER130CP39959 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.77□□□□□ -2.29
YER130CP39959 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.77□□□□□ -2.29
YER130CP39959 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.77□□□□□ -2.29
YER130CP39959 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.77□□□□□ -2.29
YER130CP39959 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.77□□□□□ -2.29
YER130CP39959 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.77□□□□□ -2.29
YER130CP39959 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.77□□□□□ -2.29
YER130CP39959 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.77□□□□□ -2.29
YER130CP39959 COG6YNL041C 2520 nt0.76□□□□□ -2.29
YER130CP39959 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt0.76□□□□□ -2.29
YER130CP39959 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.76□□□□□ -2.29
YER130CP39959 snR39BsnR39B 96 nt0.76□□□□□ -2.29
YER130CP39959 YDR210WYDR210W 228 nt0.74□□□□□ -2.29
YER130CP39959 SDH6YDR379C-A 240 nt0.74□□□□□ -2.29
YER130CP39959 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.74□□□□□ -2.29
YER130CP39959 NNF2YGR089W 2811 nt0.71□□□□□ -2.3
YER130CP39959 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.71□□□□□ -2.3
YER130CP39959 GLG1YKR058W 1851 nt0.71□□□□□ -2.3
YER130CP39959 CSE1YGL238W 2883 nt0.69□□□□□ -2.3
YER130CP39959 LTE1YAL024C 4308 nt0.68□□□□□ -2.3
YER130CP39959 YOL014WYOL014W 375 nt0.68□□□□□ -2.3
YER130CP39959 PET111YMR257C 2403 nt0.68□□□□□ -2.3
YER130CP39959 YMR160WYMR160W 2451 nt0.67□□□□□ -2.3
YER130CP39959 ULP2YIL031W 3105 nt0.67□□□□□ -2.3
YER130CP39959 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.67□□□□□ -2.3
YER130CP39959 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt0.67□□□□□ -2.3
YER130CP39959 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.67□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 71.4 ms