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Protein–RNA interactions for Protein: P35208
SPT10, Protein SPT10, yeast
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640 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
SPT10
P35208
tM(CAU)Q1
tM(CAU)Q1
76 nt
0.76
□□□□□ -2.29
SPT10
P35208
YIL002W-A
YIL002W-A
210 nt
0.76
□□□□□ -2.29
SPT10
P35208
COX5B
YIL111W
456 nt
0.76
□□□□□ -2.29
SPT10
P35208
YEL014C
YEL014C
306 nt
0.75
□□□□□ -2.29
SPT10
P35208
SEC8
YPR055W
3198 nt
0.73
□□□□□ -2.29
SPT10
P35208
YML002W
YML002W
2214 nt
0.73
□□□□□ -2.29
SPT10
P35208
YJL182C
YJL182C
318 nt
0.73
□□□□□ -2.29
SPT10
P35208
YPR160W-A
YPR160W-A
81 nt
0.73
□□□□□ -2.29
SPT10
P35208
FYV10
YIL097W
1551 nt
0.72
□□□□□ -2.29
SPT10
P35208
YLR041W
YLR041W
321 nt
0.72
□□□□□ -2.29
SPT10
P35208
snR46
snR46
197 nt
0.72
□□□□□ -2.29
SPT10
P35208
CHS6
YJL099W
2241 nt
0.72
□□□□□ -2.29
SPT10
P35208
tN(GUU)Q
tN(GUU)Q
71 nt
0.71
□□□□□ -2.3
SPT10
P35208
YKL100W-A
YKL100W-A
90 nt
0.71
□□□□□ -2.3
SPT10
P35208
snR52
snR52
92 nt
0.71
□□□□□ -2.3
SPT10
P35208
LTE1
YAL024C
4308 nt
0.7
□□□□□ -2.3
SPT10
P35208
YIL142C-A
YIL142C-A
333 nt
0.7
□□□□□ -2.3
SPT10
P35208
PRP5
YBR237W
2550 nt
0.69
□□□□□ -2.3
SPT10
P35208
YLR399W-A
YLR399W-A
105 nt
0.69
□□□□□ -2.3
SPT10
P35208
PRP42
YDR235W
1635 nt
0.68
□□□□□ -2.3
SPT10
P35208
SEC1
YDR164C
2175 nt
0.68
□□□□□ -2.3
SPT10
P35208
YJL150W
YJL150W
303 nt
0.68
□□□□□ -2.3
SPT10
P35208
PRP39
YML046W
1890 nt
0.68
□□□□□ -2.3
SPT10
P35208
YPR159C-A
YPR159C-A
102 nt
0.68
□□□□□ -2.3
SPT10
P35208
UTP8
YGR128C
2142 nt
0.66
□□□□□ -2.3
SPT10
P35208
YNL198C
YNL198C
303 nt
0.65
□□□□□ -2.31
SPT10
P35208
MYO1
YHR023W
5787 nt
0.65
□□□□□ -2.31
SPT10
P35208
OST4
YDL232W
111 nt
0.64
□□□□□ -2.31
SPT10
P35208
YEL073C
YEL073C
324 nt
0.63
□□□□□ -2.31
SPT10
P35208
YHR131W-A
YHR131W-A
246 nt
0.63
□□□□□ -2.31
SPT10
P35208
YLR342W-A
YLR342W-A
174 nt
0.63
□□□□□ -2.31
SPT10
P35208
YMR272W-A
YMR272W-A
114 nt
0.63
□□□□□ -2.31
SPT10
P35208
TRS65
YGR166W
1683 nt
0.62
□□□□□ -2.31
SPT10
P35208
YNL337W
YNL337W
255 nt
0.62
□□□□□ -2.31
SPT10
P35208
TAH1
YCR060W
336 nt
0.61
□□□□□ -2.31
SPT10
P35208
SNU13
YEL026W
381 nt
0.61
□□□□□ -2.31
SPT10
P35208
YBL039C-A
YBL039C-A
84 nt
0.61
□□□□□ -2.31
SPT10
P35208
tT(AGU)B
tT(AGU)B
73 nt
0.6
□□□□□ -2.31
SPT10
P35208
tT(AGU)C
tT(AGU)C
73 nt
0.6
□□□□□ -2.31
SPT10
P35208
tT(AGU)D
tT(AGU)D
73 nt
0.6
□□□□□ -2.31
SPT10
P35208
tT(AGU)H
tT(AGU)H
73 nt
0.6
□□□□□ -2.31
SPT10
P35208
tT(AGU)I1
tT(AGU)I1
73 nt
0.6
□□□□□ -2.31
SPT10
P35208
tT(AGU)I2
tT(AGU)I2
73 nt
0.6
□□□□□ -2.31
SPT10
P35208
tT(AGU)J
tT(AGU)J
73 nt
0.6
□□□□□ -2.31
SPT10
P35208
tT(AGU)N1
tT(AGU)N1
73 nt
0.6
□□□□□ -2.31
SPT10
P35208
tT(AGU)N2
tT(AGU)N2
73 nt
0.6
□□□□□ -2.31
SPT10
P35208
tT(AGU)O1
tT(AGU)O1
73 nt
0.6
□□□□□ -2.31
SPT10
P35208
tT(AGU)O2
tT(AGU)O2
73 nt
0.6
□□□□□ -2.31
SPT10
P35208
YJL127W-A
YJL127W-A
117 nt
0.6
□□□□□ -2.31
SPT10
P35208
YGL182C
YGL182C
324 nt
0.59
□□□□□ -2.31
SPT10
P35208
YLR232W
YLR232W
348 nt
0.59
□□□□□ -2.31
SPT10
P35208
YLR466C-B
YLR466C-B
117 nt
0.59
□□□□□ -2.31
SPT10
P35208
UTP10
YJL109C
5310 nt
0.59
□□□□□ -2.32
SPT10
P35208
YMR160W
YMR160W
2451 nt
0.59
□□□□□ -2.32
SPT10
P35208
YOR192C-B
YOR192C-B
5313 nt
0.58
□□□□□ -2.32
SPT10
P35208
YDR544C
YDR544C
429 nt
0.58
□□□□□ -2.32
SPT10
P35208
BEM3
YPL115C
3387 nt
0.57
□□□□□ -2.32
SPT10
P35208
YOR381W-A
YOR381W-A
168 nt
0.57
□□□□□ -2.32
SPT10
P35208
YSP1
YHR155W
3687 nt
0.56
□□□□□ -2.32
SPT10
P35208
UTP20
YBL004W
7482 nt
0.56
□□□□□ -2.32
SPT10
P35208
tF(GAA)B
tF(GAA)B
73 nt
0.55
□□□□□ -2.32
SPT10
P35208
tF(GAA)F
tF(GAA)F
73 nt
0.55
□□□□□ -2.32
SPT10
P35208
tF(GAA)G
tF(GAA)G
73 nt
0.55
□□□□□ -2.32
SPT10
P35208
tF(GAA)H1
tF(GAA)H1
73 nt
0.55
□□□□□ -2.32
SPT10
P35208
tF(GAA)H2
tF(GAA)H2
73 nt
0.55
□□□□□ -2.32
SPT10
P35208
tF(GAA)M
tF(GAA)M
73 nt
0.55
□□□□□ -2.32
SPT10
P35208
tF(GAA)P1
tF(GAA)P1
73 nt
0.55
□□□□□ -2.32
SPT10
P35208
tF(GAA)P2
tF(GAA)P2
73 nt
0.55
□□□□□ -2.32
SPT10
P35208
YGR151C
YGR151C
336 nt
0.55
□□□□□ -2.32
SPT10
P35208
NNF2
YGR089W
2811 nt
0.53
□□□□□ -2.32
SPT10
P35208
PAU12
YGR294W
363 nt
0.51
□□□□□ -2.33
SPT10
P35208
PET111
YMR257C
2403 nt
0.51
□□□□□ -2.33
SPT10
P35208
YOR170W
YOR170W
306 nt
0.51
□□□□□ -2.33
SPT10
P35208
SDH6
YDR379C-A
240 nt
0.5
□□□□□ -2.33
SPT10
P35208
YGL007C-A
YGL007C-A
87 nt
0.5
□□□□□ -2.33
SPT10
P35208
YLL006W-A
YLL006W-A
177 nt
0.5
□□□□□ -2.33
SPT10
P35208
YNL338W
YNL338W
159 nt
0.5
□□□□□ -2.33
SPT10
P35208
YBR072C-A
YBR072C-A
162 nt
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□□□□□ -2.33
SPT10
P35208
YBL053W
YBL053W
375 nt
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□□□□□ -2.33
SPT10
P35208
COG6
YNL041C
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□□□□□ -2.33
SPT10
P35208
Q0032
Q0032
291 nt
0.48
□□□□□ -2.33
SPT10
P35208
YDR371C-A
YDR371C-A
105 nt
0.47
□□□□□ -2.33
SPT10
P35208
RPS26A
YGL189C
360 nt
0.47
□□□□□ -2.33
SPT10
P35208
YOR225W
YOR225W
330 nt
0.47
□□□□□ -2.33
SPT10
P35208
YOR314W-A
YOR314W-A
111 nt
0.47
□□□□□ -2.33
SPT10
P35208
snR48
snR48
113 nt
0.47
□□□□□ -2.33
SPT10
P35208
BUL2
YML111W
2763 nt
0.46
□□□□□ -2.34
SPT10
P35208
NIP1
YMR309C
2439 nt
0.46
□□□□□ -2.34
SPT10
P35208
YHL015W-A
YHL015W-A
84 nt
0.46
□□□□□ -2.34
SPT10
P35208
YOR329W-A
YOR329W-A
210 nt
0.46
□□□□□ -2.34
SPT10
P35208
tL(UAA)Q
tL(UAA)Q
85 nt
0.45
□□□□□ -2.34
SPT10
P35208
YKL145W-A
YKL145W-A
93 nt
0.45
□□□□□ -2.34
SPT10
P35208
YOR102W
YOR102W
351 nt
0.45
□□□□□ -2.34
SPT10
P35208
GLG1
YKR058W
1851 nt
0.45
□□□□□ -2.34
SPT10
P35208
ORC3
YLL004W
1851 nt
0.45
□□□□□ -2.34
SPT10
P35208
ULP2
YIL031W
3105 nt
0.44
□□□□□ -2.34
SPT10
P35208
SBH1
YER087C-B
249 nt
0.44
□□□□□ -2.34
SPT10
P35208
QCR9
YGR183C
201 nt
0.44
□□□□□ -2.34
SPT10
P35208
snR39B
snR39B
96 nt
0.44
□□□□□ -2.34
SPT10
P35208
YDR210W
YDR210W
228 nt
0.42
□□□□□ -2.34
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